RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.05□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 CDS2O95674 445 aa6.04□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 INSP01308 110 aa6.04□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 CD3DP04234 171 aa6.04□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 OR5AC1P0C628 307 aa6.04□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 LYZP61626 148 aa6.04□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 TTC32Q5I0X7 151 aa6.04□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.04□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.04□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.04□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.04□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.04□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 RPRMQ9NS64 109 aa6.04□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.04□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 FAT1Q14517 4588 aa6.04□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 CBY3A6NI87 242 aa6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 ZFP92A6NM28 416 aa6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 B5MCH6 92 aa6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 OR2F1Q13607 317 aa6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 GAMTQ14353 236 aa6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 UPK3BQ9BT76 320 aa6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.03□□□□□ -1.44
TTR-204ENST00000610404 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.02□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 APOA1P02647 267 aa6.02□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 MEOX2P50222 304 aa6.02□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 LINC00315P59091 139 aa6.02□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 ESRGQ1W209 222 aa6.02□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.02□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 OR52I2Q8NH67 350 aa6.02□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 TERB2Q8NHR7 220 aa6.02□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.02□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.02□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 NAA60Q9H7X0 242 aa6.02□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 A0A0J9YY99 117 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 A0A1W2PPQ1 181 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 HPGDSO60760 199 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 B3GALNT1O75752 331 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 OR5I1Q13606 314 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 NOXA1Q86UR1 476 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 LGI3Q8N145 548 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 RNF182Q8N6D2 247 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 FRZBQ92765 325 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 YIPF6Q96EC8 236 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 C18orf15Q96N68 181 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 LINC01587Q99440 93 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 RSG1Q9BU20 258 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 SLC25A22Q9H936 323 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 MDFICQ9P1T7 246 aa6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 ZNF98A6NK75 572 aa6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 HTN1P15515 57 aa6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 TBPP20226 339 aa6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 GALR1P47211 349 aa6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 TAS2R60P59551 318 aa6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 KRTAP10-1P60331 282 aa6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 B2MP61769 119 aa6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 FAAP20Q6NZ36 180 aa6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 GPR141Q7Z602 305 aa6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 DTD1Q8TEA8 209 aa6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 C16orf74Q96GX8 76 aa6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 SLC35E1Q96K37 410 aa6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 TRGV9Q99603 122 aa6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 RBKSQ9H477 322 aa6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 HSPB7Q9UBY9 170 aa6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 MTFP1Q9UDX5 166 aa6□□□□□ -1.45
TTR-204ENST00000610404 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms