RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 B4DSR2 109 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 DISC1C4P0D8 188 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 CCRL2O00421 344 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 PTMAP06454 111 aaKnown RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 CDC42P60953 191 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 TSNQ15631 228 aaKnown RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM78BQ5VT40 261 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 BLIDQ8IZY5 108 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 JOSD2Q8TAC2 188 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 DDI1Q8WTU0 396 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 LINC00846Q9NV44 126 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 TTC41PQ6P2S7 1318 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 CEP290O15078 2479 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 DOCK5Q9H7D0 1870 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A0J9YY99 117 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 SULT1C4O75897 302 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR4E1P0C645 316 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 ANXA8P13928 327 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 CXCR4P61073 352 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 FXYD3Q14802 87 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 VAMP3Q15836 100 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 ANXA8L1Q5VT79 327 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 C8orf74Q6P047 294 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 LPCAT3Q6P1A2 487 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 Q6ZS49 121 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 Q8IZM0 81 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 PDCL2Q8N4E4 241 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 C5orf56Q8N8D9 126 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR52R1Q8NGF1 315 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR2T10Q8NGZ9 312 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 PPTC7Q8NI37 304 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 GGACTQ9BVM4 153 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 OSTCQ9NRP0 149 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 TRPM7Q96QT4 1865 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 MGAQ8IWI9 3026 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 BCL9LQ86UU0 1499 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 PLCE1Q9P212 2302 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 M0R233 179 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 NEMFO60524 1076 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 ADAP1O75689 374 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 MPC1LP0DKB6 136 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 GALP22466 123 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 PPP1R1AQ13522 171 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 GRK1Q15835 563 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 HLA-DRB5Q30154 266 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 CCL4L1Q8NHW4 92 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLAMF6Q96DU3 332 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 DCCP43146 1447 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 SPEGQ15772 3267 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A087WTM6 91 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A1B0GW15 77 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 HMMRO75330 724 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 FADS2O95864 444 aaKnown RBP-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHV3-33P01772 117 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 DYNLT1P63172 113 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 EDDM3AQ14507 147 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 DEFB132Q7Z7B7 95 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 CNBD2Q96M20 576 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 LINC00467Q9BRT7 94 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMEM14BQ9NUH8 114 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 DNAJC13O75165 2243 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 EP400Q96L91 3159 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-90P-201ENST00000606352 RREB1Q92766 1687 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-90P-201ENST00000606352 KIF27Q86VH2 1401 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-90P-201ENST00000606352 CCDC169A6NNP5 214 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-90P-201ENST00000606352 STX10O60499 249 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR2J2O76002 312 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-90P-201ENST00000606352 SNX4O95219 450 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHV3-30P01768 117 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-90P-201ENST00000606352 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-90P-201ENST00000606352 HBA1P69905 142 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-90P-201ENST00000606352 BATFQ16520 125 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-90P-201ENST00000606352 HIST2H3AQ71DI3 136 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-90P-201ENST00000606352 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-90P-201ENST00000606352 DEFB125Q8N687 156 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-90P-201ENST00000606352 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-90P-201ENST00000606352 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-90P-201ENST00000606352 ENPP5Q9UJA9 477 aa-1.79□□□□□ -2.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms