RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRNTQ86SH4 94 aa9.3□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF491Q8N8L2 437 aa9.3□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.3□□□□□ -0.92
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.29□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.29□□□□□ -0.92
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CACNA1AO00555 2505 aa9.29□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.29□□□□□ -0.92
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 P01737 135 aa9.28□□□□□ -0.92
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FMC1Q96HJ9 113 aa9.28□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EREGO14944 169 aa9.28□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GNG7O60262 68 aa9.28□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COX19Q49B96 90 aa9.28□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNS1Q96KK3 526 aa9.28□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.28□□□□□ -0.92
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UQCRFS1P47985 274 aa9.28□□□□□ -0.92
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.28□□□□□ -0.92
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.27□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.27□□□□□ -0.93
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARPC1AQ92747 370 aa9.27□□□□□ -0.93
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM120AOSQ5T036 256 aa9.27□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF562Q6V9R5 426 aa9.27□□□□□ -0.93
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa9.27□□□□□ -0.93
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.26□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2T8A6NH00 312 aa9.26□□□□□ -0.93
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H3BRN7 92 aa9.26□□□□□ -0.93
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DTX2Q86UW9 622 aa9.26□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NIT1Q86X76 327 aa9.26□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.26□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8N976 141 aa9.26□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LPAR2Q9HBW0 351 aa9.26□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa9.26□□□□□ -0.93
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFB8O95169 186 aa9.26□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLC2P0DOY2 106 aa9.26□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.26□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.26□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR4F17Q8NGA8 305 aa9.26□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACACBO00763 2458 aa9.26□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CSPG4Q6UVK1 2322 aa9.26□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1B0GXF2 115 aa9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HLA-DRB1P01911 266 aa9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SSTP61278 116 aa9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C19orf84I3L1E1 186 aa9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM11P17152 192 aa9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCN12Q6JVE5 192 aa9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C3orf79P0CE67 100 aa9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HBBP68871 147 aa9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PMCHL1Q16048 86 aa9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RASL11AQ6T310 242 aa9.25□□□□□ -0.93
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