RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXL1Q12952 345 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 REC114Q7Z4M0 266 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 UFC1Q9Y3C8 167 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PRE2 83 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 PAGE4O60829 102 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4F17Q8NGA8 305 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4F4Q96R69 305 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PS18 150 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC01619G3V211 115 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 S100A1P23297 94 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8I2Q8N0Y5 310 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM231Q9H6L2 316 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF320A2RRD8 509 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 NBEAP1P0C6P0 100 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 RXFP4Q8TDU9 374 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 DPF1Q92782 380 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM74A7A6NL05 159 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 A8MWP6 167 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 KRBOX1C9JBD0 128 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 C1QL4Q86Z23 238 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 C18orf65Q6ZTR6 163 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 OR11H1Q8NG94 326 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1N2Q8NGR9 330 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 GRAMD2BQ96HH9 432 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC35B3Q9H1N7 401 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 C11orf94C9JXX5 98 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLC2P0DOY2 106 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 BMI1P35226 326 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2G2P60604 165 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 CST9LP1Q5W188 147 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM218A2RU14 115 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 PDE6HQ13956 83 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM250H0YL14 139 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 PDE6DO43924 150 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 SRP19P09132 144 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 ELOVL1Q9BW60 279 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 GALR1P47211 349 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 CD81P60033 236 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 C16orf54Q6UWD8 224 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 MEOX2P50222 304 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 C8orf86Q6ZUL3 223 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 C11orf44Q8N8P7 122 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF586Q9NXT0 402 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 MAST4O15021 2626 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 C9JQL5 133 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 F6UZH7 168 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB136Q30KP8 78 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 LYPD1Q8N2G4 141 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 TCEAL7Q9BRU2 100 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV19A0A075B6N1 114 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A087X0K7 114 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BQ15 152 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 APOHP02749 345 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 SFTA3P0C7M3 94 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 FHL3Q13643 280 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 TM4SF20Q53R12 229 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 BLNKQ8WV28 456 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 SMPXQ9UHP9 88 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF253O75346 499 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP5G3P48201 142 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 SYNJ2BPP57105 145 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFA11Q86Y39 141 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC28AQ8IWP9 274 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 GLMPQ8WWB7 406 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 SEC11CQ9BY50 192 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM213A2RRL7 107 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 PEMTQ9UBM1 199 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-206ENST00000588815 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 CCL24O00175 119 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 MYCNOSP40205 109 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 SLURP1P55000 103 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 RAX2Q96IS3 184 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 RANP62826 216 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 PSG9Q00887 426 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa23.62■■□□□ 1.37
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