RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		18.59	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	GPR82	Q96P67	336 aa		18.59	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		18.59	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		18.58	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	RNF24	Q9Y225	148 aa		18.58	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	DEFB131A	P59861	70 aa		18.57	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	DCANP1	Q8TF63	244 aa		18.57	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	ASCL2	Q99929	193 aa		18.57	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	MFF	Q9GZY8	342 aa		18.57	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		18.57	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF124	Q15973	351 aa		18.56	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		18.56	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		18.56	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		18.56	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	PSMG4	Q5JS54	123 aa		18.55	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	B9D2	Q9BPU9	175 aa		18.55	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		18.54	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	MORN5	Q5VZ52	161 aa		18.54	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		18.54	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	C16orf92	Q96LL3	132 aa		18.54	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	ID1	P41134	155 aa		18.53	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	MEOX2	P50222	304 aa		18.53	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	FAM78B	Q5VT40	261 aa		18.53	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	AKAP14	Q86UN6	197 aa		18.53	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		18.53	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		18.53	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00052	Q96N35	136 aa		18.53	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		18.53	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	RFNG	Q9Y644	331 aa		18.53	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		18.52	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229		A8MZ25	164 aa		18.52	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		18.52	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		18.52	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		18.52	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229	CITED4	Q96RK1	184 aa		18.52	■□□□□ 0.56
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GVG6	124 aa		18.51	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		18.5	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		18.5	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	HMSD	A8MTL9	139 aa		18.49	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	ATP6V0C	P27449	155 aa		18.49	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	PSMB3	P49720	205 aa		18.49	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		18.49	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		18.49	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		18.49	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	TAAR5	O14804	337 aa		18.48	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		18.48	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	STH	Q8IWL8	128 aa		18.48	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		18.48	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	AGRN	O00468	2067 aa		18.47	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	KNCN	A6PVL3	124 aa		18.47	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229		H3BTX0	84 aa		18.47	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	ISLR	O14498	428 aa		18.47	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	SOCS3	O14543	225 aa		18.47	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF345	Q14585	488 aa		18.47	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		18.47	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	FUT9	Q9Y231	359 aa		18.47	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229		A0A087X0K7	114 aa		18.46	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		18.46	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	PFDN1	O60925	122 aa		18.46	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	RHOB	P62745	196 aa		18.46	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	HAGH	Q16775	308 aa		18.46	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		18.46	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		18.46	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		18.46	■□□□□ 0.55
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0D9SG52	128 aa		18.45	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	JTB	O76095	146 aa		18.45	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	RAB2A	P61019	212 aa		18.45	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		18.45	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	LCN15	Q6UWW0	184 aa		18.45	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		18.45	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1W2PPV4	95 aa		18.44	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	OR7C2	O60412	319 aa		18.44	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	PYY	P10082	97 aa		18.44	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	CXCL2	P19875	107 aa		18.44	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	M6PR	P20645	277 aa		18.44	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	APOC4	P55056	127 aa		18.44	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	RNF182	Q8N6D2	247 aa		18.44	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	C17orf77	Q96MU5	243 aa		18.44	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	DEFB1	P60022	68 aa		18.43	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		18.43	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		18.43	■□□□□ 0.54
GPS1-223	ENST00000584229	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		18.43	■□□□□ 0.54

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