RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289		V9GYV3	84 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF292	O60281	2723 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1W2PPI3	338 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	LY6L	H3BQJ8	138 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289		J3KRW8	73 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289		M0QZK8	103 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	SCGB1D1	O95968	90 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	RD3L	P0DJH9	198 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	GZMB	P10144	247 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	DDT	P30046	118 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	REG1B	P48304	166 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB9A	P51151	201 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	MFAP4	P55083	255 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB4B	P61018	213 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	POLE	Q07864	2286 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF329	Q86UD4	541 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ATG101	Q9BSB4	218 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	DERL1	Q9BUN8	251 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	CEP250	Q9BV73	2442 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	OTOR	Q9NRC9	128 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF492	Q9P255	531 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	PGP	A6NDG6	321 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	SNURFL	B1AK76	121 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC00587	B1AMM8	73 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	GGTLC3	B5MD39	225 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289		K7EN84	100 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	NBR2	O15453	112 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF253	O75346	499 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	APCS	P02743	223 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM106CP	P0CH98	169 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ORM2	P19652	201 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	PMCH	P20382	165 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	COL8A2	P25067	703 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	MYCNOS	P40205	109 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	IER3	P46695	156 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	CSN1S1	P47710	185 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	PSG9	Q00887	426 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	PDE6H	Q13956	83 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289		Q6AWC8	147 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	PATE2	Q6UY27	113 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289		Q6ZSV7	163 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC01560	Q8TB33	94 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	TSKU	Q8WUA8	353 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	BORCS7	Q96B45	105 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	FXYD5	Q96DB9	178 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP6V0B	Q99437	205 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	EYS	Q5T1H1	3165 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A087WYN8	130 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	C20orf202	A1L168	122 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289		A8MWP6	167 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289		I3L2K1	104 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC17A3	O00476	420 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	GNG7	O60262	68 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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