RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa24.67■■□□□ 1.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 UBQLN2Q9UHD9 624 aa24.67■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 GALR1P47211 349 aa24.66■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 ST6GAL2Q96JF0 529 aa24.66■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 GATAD1Q8WUU5 269 aa24.66■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUBA4BQ9H853 241 aa24.66■■□□□ 1.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP6D1Q9H9H5 199 aa24.64■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR11H4Q8NGC9 324 aa24.63■■□□□ 1.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRD5A3Q9H8P0 318 aa24.63■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TCTE3Q8IZS6 198 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 MEOX2P50222 304 aa24.61■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SAMD13Q5VXD3 122 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIMM9Q9Y5J7 89 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF688P0C7X2 276 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB131AP59861 70 aa24.59■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CITED4Q96RK1 184 aa24.59■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FFAR4Q5NUL3 377 aa24.58■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa24.57■■□□□ 1.52
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKAP14Q86UN6 197 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 C17orf77Q96MU5 243 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GVG6 124 aa24.56■■□□□ 1.52
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CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A087X0K7 114 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 ID1P41134 155 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNRGQ8N5I3 272 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV5A0A0B4J249 113 aa24.54■■□□□ 1.52
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF124Q15973 351 aa24.54■■□□□ 1.52
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP6V0CP27449 155 aa24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0D9SG52 128 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 C16orf92Q96LL3 132 aa24.52■■□□□ 1.52
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2G3Q8NGZ4 309 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CXCL2P19875 107 aa24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 M6PRP20645 277 aa24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYTL1Q9NRR1 136 aa24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1QBP02746 253 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLC2P0DOY2 106 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERF2P84101 59 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa24.49■■□□□ 1.51
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ASCL2Q99929 193 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 HRH4Q9H3N8 390 aa24.49■■□□□ 1.51
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LCN15Q6UWW0 184 aa24.48■■□□□ 1.51
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TGP01266 2768 aa24.47■■□□□ 1.51
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A2Q9BXI2 301 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH3BGRL3Q9H299 93 aa24.47■■□□□ 1.51
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GUK1Q16774 197 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC20Q8TCA0 184 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 STHQ8IWL8 128 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGRNO00468 2067 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 H3BQ15 152 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCL2L11O43521 198 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 MBP02144 154 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB2AP61019 212 aa24.44■■□□□ 1.5
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