RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 SSR3Q9UNL2 185 aa7.02□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 C1QBP02746 253 aa7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 RHOBP62745 196 aa7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 GAMTQ14353 236 aa7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 NMSQ5H8A3 153 aa7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC25A22Q9H936 323 aa7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 H7BYZ3 331 aa7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRSS3P35030 304 aa7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 KIR3DS1Q14943 382 aa7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 LYPD5Q6UWN5 251 aa7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q6ZSA8 131 aa7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q6ZTI0 123 aa7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 NOXA1Q86UR1 476 aa7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF738Q8NE65 137 aa7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR8A1Q8NGG7 326 aa7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPX8Q8TED1 209 aa7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 LY96Q9Y6Y9 160 aa7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 SNURFLB1AK76 121 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 RCVRNP35243 200 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 CDKN1BP46527 198 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 CACNG5Q9UF02 275 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 CDS2O95674 445 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR5AC1P0C628 307 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 FGL1Q08830 312 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM219AQ8IW50 185 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q8N814 137 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 IL22RA2Q969J5 263 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 TNXBP22105 4242 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 K7EP13 123 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 PAX4O43316 350 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 FABP1P07148 127 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 EVI2AP22794 236 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 NCS1P62166 190 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 MEF2DQ14814 521 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC35E1Q96K37 410 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRGV9Q99603 122 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 COPZ2Q9P299 210 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 U3KQ87 197 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.96□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 GABARAPH6UMI1 98 aa6.96□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 PSCAO43653 123 aa6.96□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 GABARAPO95166 117 aa6.96□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 VBP1P61758 197 aa6.96□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 PSG3Q16557 428 aa6.96□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.96□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 LGI3Q8N145 548 aa6.96□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.96□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.96□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPR82Q96P67 336 aa6.96□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.96□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.96□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM127O75204 238 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 CRYGDP07320 174 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 CXCL3P19876 107 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 SCXQ7RTU7 201 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 THAP8Q8NA92 274 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 B3GALNT1O75752 331 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 ORM2P19652 201 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 CTF1Q16619 201 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPR107Q5VW38 600 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 155.1 ms