RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 C17orf112F2Z3M2 114 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 M0R233 179 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SULT1C4O75897 302 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 LY6G6CO95867 125 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 TNNC2P02585 160 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SERPINE1P05121 402 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 OCM2P0CE71 109 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CD79AP11912 226 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SERPINB9P50453 376 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 TCL1AP56279 114 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 LYRM7Q5U5X0 104 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 Q8IYB0 196 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 OR5AS1Q8N127 324 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 C10orf111Q8N326 155 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 C5orf17Q8NAS9 161 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 OR10K1Q8NGX5 313 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 WFDC5Q8TCV5 224 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 RAB37Q96AX2 223 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 C2orf50Q96LR7 162 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 GGACTQ9BVM4 153 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 C20orf27Q9GZN8 174 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 EVC2Q86UK5 1308 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 HECW1Q76N89 1606 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CREBBPQ92793 2442 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 MUC2Q02817 5179 aa-0.25□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ESPL1Q14674 2120 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGEF11O15085 1522 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 NUP155O75694 1391 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 OR4C46A6NHA9 309 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 FAM159BA6NKW6 160 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 LRRN3E7EW58 273 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SLC16A4O15374 487 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 NDUFB3O43676 98 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 DCTN3O75935 186 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 HAND1O96004 215 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CFDP00746 253 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 OR10J4P0C629 311 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 PPIBP23284 216 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 RPL5P46777 297 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 DEFA1P59665 94 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ROMO1P60602 79 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 RPS20P60866 119 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SPCS3P61009 180 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 VBP1P61758 197 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 RPL37P61927 97 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 COX6A2Q02221 97 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 BCL2L15Q5TBC7 163 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 C1orf134Q5TEV5 83 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 FAM151BQ6UXP7 276 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 IDO2Q6ZQW0 420 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00299Q6ZSB3 139 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 S100A7AQ86SG5 101 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 PDZD9Q8IXQ8 264 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 FAM9CQ8IZT9 166 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 OR51A2Q8NGJ7 313 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 Q8TAT8 98 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 DCUN1D1Q96GG9 259 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 YPEL2Q96QA6 119 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 PKIGQ9Y2B9 76 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SPTA1P02549 2419 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-0.26□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 NEO1Q92859 1461 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ERBINQ96RT1 1412 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 A0A087WSZ3 146 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV27A0A087WT01 109 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 A0A0A6YYH2 397 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 A6NJ64 397 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 A8MT66 165 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 M0QX08 132 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 DEXIO95424 95 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SMIM17P0DL12 118 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ETV6P41212 452 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 RAB5CP51148 216 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 HIST3H3Q16695 136 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 XAF1Q6GPH4 301 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 C22orf39Q6P5X5 142 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 Q6Q795 121 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ARPINQ7Z6K5 226 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 OR6V1Q8N148 313 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms