RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, human

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTA-208	ENST00000558954	LEMD1	Q68G75	181 aa		14	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		14	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		14	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	PFDN5	Q99471	154 aa		14	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	ZMAT4	Q9H898	229 aa		14	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		14	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		14	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	PATE2	Q6UY27	113 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	ZNF709	Q8N972	641 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	IFNA5	P01569	189 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	APOC4	P55056	127 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	ZNF124	Q15973	351 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	AQP10	Q96PS8	301 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	SPATA25	Q9BR10	227 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	ID1	P41134	155 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	PSMB3	P49720	205 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954		Q5BKY6	102 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	PSMG4	Q5JS54	123 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954		U3KQK5	164 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	TENM3	Q9P273	2699 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	ISLR	O14498	428 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	RSG1	Q9BU20	258 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	SOCS3	O14543	225 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	RCHY1	Q96PM5	261 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	ZNF266	Q14584	549 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	STH	Q8IWL8	128 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	C16orf92	Q96LL3	132 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954		A0A087X0K7	114 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	MORN5	Q5VZ52	161 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	RNF222	A6NCQ9	220 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954		G3V3Q6	166 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	UBE2C	O00762	179 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	LINC00052	Q96N35	136 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	WFDC1	Q9HC57	220 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	KNCN	A6PVL3	124 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	LCN15	Q6UWW0	184 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	C17orf77	Q96MU5	243 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	CXCL2	P19875	107 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	FAM78B	Q5VT40	261 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954		Q6ZWC4	215 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	CSTL1	Q9H114	145 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	RETN	Q9HD89	108 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	RPRM	Q9NS64	109 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	ARPC5	O15511	151 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	SPP1	P10451	314 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	HLA-DRB4	P13762	266 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	DEFB135	Q30KP9	77 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954		Q6ZNX1	250 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	HRH4	Q9H3N8	390 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	SMLR1	H3BR10	107 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	IGLC2	P0DOY2	106 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	GUK1	Q16774	197 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	C20orf173	Q96LM9	149 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RABGGTA-208	ENST00000558954		H3BMM0	161 aa		13.86	□□□□□ -0.19

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