RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557261.1

FOXN3-215, Transcript of forkhead box N3, human

TSL 4

Gene FOXN3, Length 625 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FOXN3-215	ENST00000557261	ACAN	P16112	2415 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261		M0QZK8	103 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	IFNA10	P01566	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	FBP1	P09467	338 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	S100A1	P23297	94 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	CDKN1B	P46527	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	CLINT1	Q14677	625 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	NRGN	Q92686	78 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	REG4	Q9BYZ8	158 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	CYB5B	O43169	146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	NXPH4	O95158	308 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	BRI3	O95415	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	CA2	P00918	260 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	CRYGC	P07315	174 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	SNCA	P37840	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	DLX1	P56177	255 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	PLP1	P60201	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	WT1-AS	Q06250	92 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	RAB31	Q13636	194 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261		A0A1B0GUS0	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261		A0A1B0GW64	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261		A0A1W2PRD5	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261		A0A1W2PRF3	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261		A0A1W2PRM7	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	HBE1	P02100	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	IFNA4	P05014	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	CTRB1	P17538	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	OPRK1	P41145	380 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	PLGLA	Q15195	96 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	TNXA	Q16473	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261		Q8N9W7	124 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	ARPC1A	Q92747	370 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	P2RX4	Q99571	388 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261		E7EUB6	86 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	ATP5L	O75964	103 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	OR13C7	P0DN81	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	FGF7	P21781	194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	CNTFR	P26992	372 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	RAB2A	P61019	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	SELENOT	P62341	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	HES1	Q14469	280 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	LAGE3	Q14657	143 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	FXYD3	Q14802	87 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOXN3-215	ENST00000557261	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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