RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 OR8I2Q8N0Y5 310 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 OR52I2Q8NH67 350 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.54□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 COMMD3Q9UBI1 195 aa4.54□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 A6NJY4 79 aa4.53□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 SLC17A3O00476 420 aa4.53□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 SIVA1O15304 175 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 IGHV3-53P01767 116 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 IAPPP10997 89 aa4.53□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 ERVFC1-1P60608 527 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 NCS1P62166 190 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 C1orf194Q5T5A4 169 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 MORN5Q5VZ52 161 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM268Q5VZI3 342 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 LPCAT3Q6P1A2 487 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 PATE2Q6UY27 113 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM144Q7Z5S9 345 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF738Q8NE65 137 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 OR8A1Q8NGG7 326 aa4.53□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 KLF12Q9Y4X4 402 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
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CTDSP2-208ENST00000552294 CT45A10P0DMU9 189 aa4.52□□□□□ -1.69
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CTDSP2-208ENST00000552294 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa4.52□□□□□ -1.69
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CTDSP2-208ENST00000552294 GPR141Q7Z602 305 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 LGI3Q8N145 548 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 THAP8Q8NA92 274 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.52□□□□□ -1.69
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CTDSP2-208ENST00000552294 YIPF6Q96EC8 236 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 C16orf74Q96GX8 76 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 VCXQ9H320 206 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 NAA60Q9H7X0 242 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 HSPB7Q9UBY9 170 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.51□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.51□□□□□ -1.69
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CTDSP2-208ENST00000552294 H3BRN7 92 aa4.51□□□□□ -1.69
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CTDSP2-208ENST00000552294 IFNA5P01569 189 aa4.51□□□□□ -1.69
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CTDSP2-208ENST00000552294 PRR9Q5T870 116 aa4.51□□□□□ -1.69
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CTDSP2-208ENST00000552294 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 MIXL1Q9H2W2 232 aa4.51□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 COPZ2Q9P299 210 aa4.51□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 GPR132Q9UNW8 380 aa4.51□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa4.51□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 LPAP08519 4548 aa4.51□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.5□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 H3BNG1 76 aa4.5□□□□□ -1.69
CTDSP2-208ENST00000552294 PITX3O75364 302 aa4.5□□□□□ -1.69
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