RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 OR1S1Q8NH92 325 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 TRGV9Q99603 122 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 EPM2AB3EWF7 344 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 FABP1P07148 127 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 MEOX2P50222 304 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 GPR141Q7Z602 305 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 OR51S1Q8NGJ8 323 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 MIXL1Q9H2W2 232 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.17□□□□□ -0.62
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CS-227ENST00000551441 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 AKR1C4P17516 323 aa11.17□□□□□ -0.62
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CS-227ENST00000551441 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 AP3S1Q92572 193 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-227ENST00000551441 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
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CS-227ENST00000551441 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
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CS-227ENST00000551441 RAB11AP62491 216 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 TMEM144Q7Z5S9 345 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 C16orf74Q96GX8 76 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 TMEM147Q9BVK8 224 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 Q9H3A6 140 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 MYCBP2O75592 4640 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
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CS-227ENST00000551441 GAGE12IP0CL82 117 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 TAS2R60P59551 318 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 TTC32Q5I0X7 151 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.13□□□□□ -0.63
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CS-227ENST00000551441 AKR1C1Q04828 323 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 CTF1Q16619 201 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 OR8A1Q8NGG7 326 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 RXFP4Q8TDU9 374 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 C15orf40Q8WUR7 153 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 PRRT1Q99946 306 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 MCUBQ9NWR8 336 aa11.12□□□□□ -0.63
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CS-227ENST00000551441 H3BRN7 92 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 J3KRW8 73 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
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CS-227ENST00000551441 OR4D5Q8NGN0 318 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
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CS-227ENST00000551441 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 SMCO3A2RU48 225 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 PRSS46E5RG02 174 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 PITX3O75364 302 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 CFDP00746 253 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 CXCL3P19876 107 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 BTF3P20290 206 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 M6PRP20645 277 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 XGP55808 180 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 SPANXN5Q5MJ07 72 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 Q5VSD8 79 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 TMEM256Q8N2U0 113 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 LRRC20Q8TCA0 184 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 SLC45A2Q9UMX9 530 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 OR5G3P0C626 314 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 PSG3Q16557 428 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 TMED4Q7Z7H5 227 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 OR10J6PQ8NGY7 276 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 GPR82Q96P67 336 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-227ENST00000551441 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
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