RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		0.61	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125		A0A1W2PPM0	123 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	OR2T8	A6NH00	312 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	NUPR1	O60356	82 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	CST2	P09228	141 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	S100A5	P33763	92 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	CEP19	Q96LK0	163 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	LINC00052	Q96N35	136 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125		E5RI56	91 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	CYBA	P13498	195 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	CAPZB	P47756	277 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	ROMO1	P60602	79 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	VBP1	P61758	197 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	TEN1	Q86WV5	123 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	GGACT	Q9BVM4	153 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-231	ENST00000544125	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		0.59	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	MED12	Q93074	2177 aa		0.59	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125		B4DSR2	109 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125		F8W1H4	67 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125		H3BRM9	83 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125		M0R233	179 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	AIP	O00170	330 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PFDN1	O60925	122 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	ERC2-IT1	O76042	136 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	DYNLT3	P51808	116 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	NCALD	P61601	193 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	POU6F1	Q14863	301 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	HACD4	Q5VWC8	232 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	STX12	Q86Y82	276 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	IFT20	Q8IY31	132 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	AP3S1	Q92572	193 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	TEX37	Q96LM6	180 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	CENPH	Q9H3R5	247 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	MED29	Q9NX70	200 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125		V9GYQ6	96 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PIK3C2A	O00443	1686 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125		E7EUB6	86 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	NDUFC2	O95298	119 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	NFYB	P25208	207 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	CDK6	Q00534	326 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PXT1	Q8NFP0	134 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125		Q8TAT8	98 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	RAB37	Q96AX2	223 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	MUCL1	Q96DR8	90 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PRRT1	Q99946	306 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125		G3V2T6	193 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125		H7C1C5	153 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125		M0R378	163 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	IFNA1	P01562	189 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	CXCL8	P10145	99 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	HLA-E	P13747	358 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	PHB	P35232	272 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	TCTA	P57738	103 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	LCN6	P62502	163 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	TRIQK	Q629K1	86 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	GRINA	Q7Z429	371 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	OR4K15	Q8NH41	348 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	MALSU1	Q96EH3	234 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF714	Q96N38	554 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-231	ENST00000544125	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32

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