RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 MGST2Q99735 147 aa6.86□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.86□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 H0Y8G0 127 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 CORTO00230 105 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 CCL25O15444 150 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 IGHV3-48P01763 117 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 CRISP2P16562 243 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 AMTP48728 403 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 SPATA45Q537H7 98 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 RNF114Q9Y508 228 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 A6NDX4 124 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 RAB31Q13636 194 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 LCN12Q6JVE5 192 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 DIRC3C9JPN6 131 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 CRYGCP07315 174 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 TPPP2P59282 170 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-210ENST00000541576 M0QZK8 103 aa6.84□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 AMY1AP04745 511 aa6.84□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 MIC13Q5XKP0 118 aa6.84□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 LEMD1Q68G75 181 aa6.84□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.84□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 TEX29Q8N6K0 151 aa6.84□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 SNURFLB1AK76 121 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 ATP6V0E1O15342 81 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 MT-CO2P00403 227 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 TCTAP57738 103 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 IGHV4-59P01825 116 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 ECSCRQ19T08 205 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 NPIPB3Q92617 1050 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 MTORP42345 2549 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 F6UZH7 168 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 LINC00614P0C842 121 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 NPPCP23582 126 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 STPG3Q8N7X2 389 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 LINC01548A6NM66 108 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 I3L2K1 104 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 CD5LO43866 347 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 UHRF2Q96PU4 802 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 A0A1W2PPV4 95 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 LINC00869P0C866 280 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 Q6YL49 198 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 THAP8Q8NA92 274 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 K7EIM0 57 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 PRR20EP86478 221 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 PRR20CP86479 221 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 PRR20DP86480 221 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 PRR20BP86481 221 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 PRR20AP86496 221 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 Q56UQ5 140 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 THYN1Q9P016 225 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 G3V318 75 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 RBX1P62877 108 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-210ENST00000541576 GAGE1Q13065 139 aa6.81□□□□□ -1.32
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