RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 GAGE12FP0CL80 117 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 GAGE12GP0CL81 117 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 GAGE12IP0CL82 117 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-204ENST00000538708 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-204ENST00000538708 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 ADMP35318 185 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 RNF222A6NCQ9 220 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.59□□□□□ -1.19
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