RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 THAP8Q8NA92 274 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 OR4D5Q8NGN0 318 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 OR52I2Q8NH67 350 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 YIPF6Q96EC8 236 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 SLC35E1Q96K37 410 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 LINC01587Q99440 93 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 A0A0J9YY99 117 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 HPGDSO60760 199 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 ERVFC1-1P60608 527 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 LSM3P62310 102 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 OR1B1Q8NGR6 318 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 RBKSQ9H477 322 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 SLC25A22Q9H936 323 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 MDFICQ9P1T7 246 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 GABARAPH6UMI1 98 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 GABARAPO95166 117 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 ICAM4Q14773 271 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 GPR107Q5VW38 600 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM229BQ8NBD8 167 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 IL22RA2Q969J5 263 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 GPR82Q96P67 336 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 TNFAIP8O95379 198 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 CFDP00746 253 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 A0A087WTM6 91 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 A0A096LPF7 62 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 PRSS46E5RG02 174 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 EREGO14944 169 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 RAB3DO95716 219 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 HTN1P15515 57 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 CCR6P51684 374 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 TAS2R19P59542 299 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 SMCO1Q147U7 214 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 FAAP20Q6NZ36 180 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 STEAP1BQ6NZ63 245 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF738Q8NE65 137 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 PRR13Q9NZ81 148 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 GPR132Q9UNW8 380 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 H7BYZ3 331 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 ADAP1O75689 374 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 CXCL3P19876 107 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 CDKN1BP46527 198 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 GGNBP1Q5YKI7 109 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 Q6ZSN1 163 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 A0A0B4J2A0 478 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 GAGE12BA1L429 117 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 H3BRN7 92 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 SIVA1O15304 175 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 GAGE7O76087 117 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 GAGE12FP0CL80 117 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 GAGE12GP0CL81 117 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 GAGE12IP0CL82 117 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 NCS1P62166 190 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 KIR3DS1Q14943 382 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 Q9H521 79 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 SHPKQ9UHJ6 478 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 A0A087X0K7 114 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 FAM229AH3BQW9 127 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 J3QL48 77 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 IFNA5P01569 189 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 ORM2P19652 201 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 RHOBP62745 196 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 LYZL2Q7Z4W2 148 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 BPIFCQ8NFQ6 507 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 FAM25AB3EWG3 89 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 FAM25CB3EWG5 89 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 FAM25GB3EWG6 89 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 PITX3O75364 302 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 RLN2P04090 185 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 HAMPP81172 84 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 FGL1Q08830 312 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 PSG3Q16557 428 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 OR1S1Q8NH92 325 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM147Q9BVK8 224 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 EXTL2Q9UBQ6 330 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 NXPH4O95158 308 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 RPL7P18124 248 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 GCSHP23434 173 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms