RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518136.3

HOXA13-202, Transcript of homeobox A13, humanhuman

TSL 2

Gene HOXA13, Length 871 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-202ENST00000518136 TEX46H3BTG2 121 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 IFNA7P01567 189 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 ORM2P19652 201 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 CCL20P78556 96 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 RAB31Q13636 194 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 FAM209BQ5JX69 171 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 LEMD1Q68G75 181 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 Q6ZRG5 221 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 ZNF709Q8N972 641 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 OR11H1Q8NG94 326 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.32□□□□□ -1.4
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HOXA13-202ENST00000518136 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 A8MWP6 167 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 UMAD1C9J7I0 102 aa6.31□□□□□ -1.4
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HOXA13-202ENST00000518136 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 SYNJ2BPP57105 145 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 GPHB5Q86YW7 130 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 RAB24Q969Q5 203 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.31□□□□□ -1.4
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HOXA13-202ENST00000518136 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.31□□□□□ -1.4
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HOXA13-202ENST00000518136 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 A0A1B0GV50 99 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 LINC01619G3V211 115 aa6.3□□□□□ -1.4
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HOXA13-202ENST00000518136 COX7A2P2O60397 106 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 STAG3L2P0CL84 134 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 STAG3L3P0CL85 134 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 PYYP10082 97 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 GP9P14770 177 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 CRYBB3P26998 211 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 RAB5CP51148 216 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 RPEL1Q2QD12 228 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 CLLU1Q5K131 121 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 FAM78BQ5VT40 261 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 LCN15Q6UWW0 184 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 Q8WTZ3 238 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 DNHD1Q96M86 4753 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 ZNF98A6NK75 572 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 LGALS9O00182 355 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 BUB3O43684 328 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 MBP02144 154 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 FABP1P07148 127 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 RHOBP62745 196 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 SUN5Q8TC36 379 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 GLMPQ8WWB7 406 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 FXYD5Q96DB9 178 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 PFDN5Q99471 154 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXA13-202ENST00000518136 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.29□□□□□ -1.4
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