RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514705.5

TSPAN17-208, Transcript of tetraspanin 17, human

TSL 2

Gene TSPAN17, Length 4,445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN17-208	ENST00000514705	CST9L	Q9H4G1	147 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	GAGE12B	A1L429	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGLV2-8	P01709	118 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	MSMP	Q1L6U9	139 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	TEX45	Q8NA69	505 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	FXYD5	Q96DB9	178 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	CREBBP	Q92793	2442 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705		E7EUB6	86 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	PSG9	Q00887	426 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	GUSBP1	Q15486	140 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	CTRL	P40313	264 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	C1orf159	Q96HA4	380 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	C17orf100	A8MU93	164 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705		M0R3E3	92 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGHV3-23	P01764	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	OTOR	Q9NRC9	128 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	FABP2	P12104	132 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	PATE2	Q6UY27	113 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	PSG8	Q9UQ74	426 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	CGB1	A6NKQ9	187 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705		J3KRW8	73 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	ITGB1BP1	O14713	200 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	TOMM40	O96008	361 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGHG3	P01860	377 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	TIMD4	Q96H15	378 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705		D6R8Y8	96 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGLV1-44	P01699	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	LYNX1	P0DP58	116 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	BSPH1	Q075Z2	132 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	POU2AF1	Q16633	256 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	NCR2	O95944	276 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	CNTFR	P26992	372 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	CFHR2	P36980	270 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	ORMDL3	Q8N138	153 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR4A5	Q8NH83	315 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	SMKR1	H3BMG3	65 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705		J3QR89	54 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705		Q86TA4	180 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TSPAN17-208	ENST00000514705	C2orf70	A6NJV1	201 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	CD5L	O43866	347 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705		Q8N976	141 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	AMN1	Q8IY45	258 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM231B	A6NCW3	169 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	GTSF1	Q8WW33	167 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	TRGV9	Q99603	122 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	SMIM12	Q96EX1	92 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGF2R	P11717	2491 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM160	Q9NX00	188 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM213	A2RRL7	107 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	RNF125	Q96EQ8	232 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	KLK15	Q9H2R5	256 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	CLEC3B	P05452	202 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSPAN17-208	ENST00000514705	SEC11A	P67812	179 aa		11.12	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms