RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513542.1

SMAD1-AS1-201, SMAD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMAD1-AS1, Length 481 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 Q6ZRG5 221 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ASCL2Q99929 193 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TUBA4BQ9H853 241 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SOCS3O14543 225 aa9.92□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ARPC5O15511 151 aa9.92□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IFNA5P01569 189 aa9.92□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GALR1P47211 349 aa9.92□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DEFB131AP59861 70 aa9.92□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 OR11H4Q8NGC9 324 aa9.92□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ST6GAL2Q96JF0 529 aa9.92□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PFDN5Q99471 154 aa9.92□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FAM110AQ9BQ89 295 aa9.92□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.92□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 A0A1B0GVG6 124 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 S100A7P31151 101 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF709Q8N972 641 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GPR82Q96P67 336 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RPL7P18124 248 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PSMG4Q5JS54 123 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DEFB1P60022 68 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF266Q14584 549 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HAGHQ16775 308 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 S100A7AQ86SG5 101 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MFFQ9GZY8 342 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 A0A087X0K7 114 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KNCNA6PVL3 124 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 H3BTX0 84 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ATP6V0CP27449 155 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PSMB3P49720 205 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MEOX2P50222 304 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FAM78BQ5VT40 261 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MIR17HGQ75NE6 70 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C20orf173Q96LM9 149 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.87□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HMSDA8MTL9 139 aa9.87□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ISLRO14498 428 aa9.87□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IGLC2P0DOY2 106 aa9.87□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CXCL2P19875 107 aa9.87□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RAB2AP61019 212 aa9.87□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CD300CQ08708 224 aa9.87□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF345Q14585 488 aa9.87□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.87□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.87□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TCTE3Q8IZS6 198 aa9.87□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RNF182Q8N6D2 247 aa9.87□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C16orf92Q96LL3 132 aa9.87□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LINC00052Q96N35 136 aa9.87□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.87□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RETNQ9HD89 108 aa9.87□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 H3BQ15 152 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SLC17A3O00476 420 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PYYP10082 97 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HLA-DMBP28068 263 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ID1P41134 155 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 AKAP14Q86UN6 197 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RNF24Q9Y225 148 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FUT9Q9Y231 359 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.85□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.85□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.85□□□□□ -0.83
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LCN15Q6UWW0 184 aa9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms