RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 A8MTW9 85 aa12□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa12□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 TMEM147Q9BVK8 224 aa12□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 DNAH17Q9UFH2 4485 aa11.99□□□□□ -0.49
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HERC3-211ENST00000513325 PRM2P04554 102 aa11.99□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 CNN1P51911 297 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
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HERC3-211ENST00000513325 RNF182Q8N6D2 247 aa11.99□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 GPR82Q96P67 336 aa11.99□□□□□ -0.49
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HERC3-211ENST00000513325 S100A7P31151 101 aa11.98□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 SPINK13Q1W4C9 94 aa11.98□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 TMEM88Q6PEY1 159 aa11.98□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 Q6ZR54 194 aa11.98□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 TMEM144Q7Z5S9 345 aa11.98□□□□□ -0.49
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HERC3-211ENST00000513325 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
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HERC3-211ENST00000513325 H3BRN7 92 aa11.97□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 M0R2Z0 102 aa11.97□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 CRXO43186 299 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
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HERC3-211ENST00000513325 S100A5P33763 92 aa11.97□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP11.97□□□□□ -0.49
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HERC3-211ENST00000513325 RNF212Q495C1 297 aa11.97□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa11.97□□□□□ -0.49
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HERC3-211ENST00000513325 MED14OSP0DP75 135 aa11.96□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 RAP2BP61225 183 aa11.96□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 CCDC190Q86UF4 302 aa11.96□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.96□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 PSENENQ9NZ42 101 aa11.96□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 HIGD1AQ9Y241 93 aa11.96□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 C9orf170A2RU37 121 aa11.95□□□□□ -0.5
HERC3-211ENST00000513325 PMS2P5A8MQ11 134 aa11.95□□□□□ -0.5
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HERC3-211ENST00000513325 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa11.94□□□□□ -0.5
HERC3-211ENST00000513325 CCDC160A6NGH7 325 aa11.94□□□□□ -0.5
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HERC3-211ENST00000513325 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HERC3-211ENST00000513325 SMIM8Q96KF7 97 aa11.93□□□□□ -0.5
HERC3-211ENST00000513325 SRRQ9GZT4 340 aa11.93□□□□□ -0.5
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HERC3-211ENST00000513325 TSPOP30536 169 aa11.92□□□□□ -0.5
HERC3-211ENST00000513325 SELENOTP62341 195 aa11.92□□□□□ -0.5
HERC3-211ENST00000513325 RHOBP62745 196 aa11.92□□□□□ -0.5
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HERC3-211ENST00000513325 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.92□□□□□ -0.5
HERC3-211ENST00000513325 OR8A1Q8NGG7 326 aa11.92□□□□□ -0.5
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HERC3-211ENST00000513325 PSG3Q16557 428 aa11.91□□□□□ -0.5
HERC3-211ENST00000513325 BAK1Q16611 211 aa11.91□□□□□ -0.5
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HERC3-211ENST00000513325 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.91□□□□□ -0.5
HERC3-211ENST00000513325 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa11.91□□□□□ -0.5
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HERC3-211ENST00000513325 LRRC20Q8TCA0 184 aa11.91□□□□□ -0.5
HERC3-211ENST00000513325 LINC01587Q99440 93 aa11.91□□□□□ -0.5
HERC3-211ENST00000513325 ARL6Q9H0F7 186 aa11.91□□□□□ -0.5
HERC3-211ENST00000513325 NPVFQ9HCQ7 196 aa11.91□□□□□ -0.5
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa11.91□□□□□ -0.5
HERC3-211ENST00000513325 PKD1P98161 4303 aa11.9□□□□□ -0.5
HERC3-211ENST00000513325 NAP1L6A6NFF2 107 aa11.9□□□□□ -0.5
HERC3-211ENST00000513325 OR4E1P0C645 316 aa11.9□□□□□ -0.5
HERC3-211ENST00000513325 ATG101Q9BSB4 218 aa11.9□□□□□ -0.5
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