RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 CACNG7P62955 275 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 CD69Q07108 199 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 OR8A1Q8NGG7 326 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 TRGV9Q99603 122 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 DPH3P1Q9H4G8 78 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 SZT2Q5T011 3432 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 SYNGR2O43760 224 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 C1orf105O95561 183 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 CISD3P0C7P0 127 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 P0DMU3 169 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 FAM231AP0DMU4 169 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 FAM231CP0DMU5 169 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PGPA6NDG6 321 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 AVPP01185 164 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 MYCNOSP40205 109 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 GFERP55789 205 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 HBBP68871 147 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 RPRMLQ8N4K4 120 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PCSK5Q92824 1860 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PTPRSQ13332 1948 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 FANCMQ8IYD8 2048 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 A0A1B0GXF2 115 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 EPM2AB3EWF7 344 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 K7EMI3 77 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 FCER1GP30273 86 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 CCL14Q16627 93 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 ZFP2Q6ZN57 461 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PIP4P2Q8N4L2 257 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LINC01600Q96MT4 127 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 ZMAT4Q9H898 229 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 OTORQ9NRC9 128 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 R4GMQ9 66 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LMO2P25791 158 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 CXCL5P42830 114 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 HCSTQ9UBK5 93 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 C19orf71A6NCJ1 209 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 H3BMM0 161 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 UBE2WQ96B02 151 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 FOXB1Q99853 325 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 NPCDR1Q9BY65 106 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 MYO7AQ13402 2215 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LINC01549A6NIU2 74 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 H3BT86 120 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 M0QZQ0 153 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 IGLV3-25P01717 112 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 COL8A2P25067 703 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 HILS1P60008 231 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 FAM201AQ5SY85 155 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 DRAM1Q8N682 238 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 C16orf95Q9H693 158 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF442Q9H7R0 627 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PRDM6Q9NQX0 595 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 SMCHD1A6NHR9 2005 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PRSS46E5RG02 174 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 ARL14EPLP0DKL9 152 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 IAPPP10997 89 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LIFP15018 202 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 GRNP28799 593 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 Q6ZR03 302 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PDFQ9HBH1 243 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PCNX3Q9H6A9 2034 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 ACYP1P07311 99 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 RPS27P42677 84 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 CCL8P80075 99 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 SPANXN5Q5MJ07 72 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 C11orf53Q8IXP5 236 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 NT5CQ8TCD5 201 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 SMIM14Q96QK8 99 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 CALYQ9NYX4 217 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 MYBPHLA2RUH7 354 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 KIF26BQ2KJY2 2108 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 ARTNQ5T4W7 220 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 COPS9Q8WXC6 57 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF503Q96F45 646 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 FGF22Q9HCT0 170 aa4.9□□□□□ -1.63
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