RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502260.5

SH3BP2-205, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-205ENST00000502260 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 FNDC10F2Z333 226 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 K7EPK0 472 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 GOSR2O14653 212 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 MIFP14174 115 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 ORM2P19652 201 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 S100A7P31151 101 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 BCAP31P51572 246 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 FCN2Q15485 313 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 OR1B1Q8NGR6 318 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 TMEM147Q9BVK8 224 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 SLC45A2Q9UMX9 530 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 X6R8D5 127 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 RYR1P21817 5038 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 C4BPBP20851 252 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 S100A10P60903 97 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF98A6NK75 572 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 SIX6O95475 246 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 SPP1P10451 314 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 ID1P41134 155 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 CAV2P51636 162 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 SELENOTP62341 195 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 ARL16Q0P5N6 197 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 TEPPQ6URK8 271 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 OR11H7Q8NGC8 314 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 RNF126Q9BV68 326 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 SLC25A22Q9H936 323 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 DOK5Q9P104 306 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 LINC00869P0C866 280 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 MED14OSP0DP75 135 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 CXCL3P19876 107 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 GALR1P47211 349 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 RAP2BP61225 183 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 CYCSP99999 105 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 IL15RAQ13261 267 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 RAB32Q13637 225 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 LINC00052Q96N35 136 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 GGACTQ9BVM4 153 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 NMES1Q9C002 83 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 SLC25A32Q9H2D1 315 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 HYPMO75409 117 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 CST7O76096 145 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 OR5G3P0C626 314 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 PSMB3P49720 205 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 H2BFSP57053 126 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 PLP1P60201 277 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 SLC38A11Q08AI6 406 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 C12orf74Q32Q52 190 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 ASB13Q8WXK3 278 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 GPR82Q96P67 336 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 RSG1Q9BU20 258 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 CELA1Q9UNI1 258 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 PKHD1P08F94 4074 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 H3BMM0 161 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 H3BRN7 92 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 ISLRO14498 428 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 SOCS3O14543 225 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 RTL8CO15255 209 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 AMBPP02760 352 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 MEOX2P50222 304 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 S100A7AQ86SG5 101 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF546Q86UE3 836 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 SCRT1Q9BWW7 348 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 AGPAT2O15120 278 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 GIPP09681 153 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 HLA-DRB4P13762 266 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 C16orf92Q96LL3 132 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 ARL6Q9H0F7 186 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 IGSF23A1L1A6 192 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 P0DMU3 169 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM231AP0DMU4 169 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM231CP0DMU5 169 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.3 ms