RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 FGF7P21781 194 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 ID1P41134 155 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 PSMB3P49720 205 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 MEOX2P50222 304 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRR20EP86478 221 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRR20CP86479 221 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRR20DP86480 221 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRR20BP86481 221 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRR20AP86496 221 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 FCN2Q15485 313 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 MIC13Q5XKP0 118 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 RNF183Q96D59 192 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 MED28Q9H204 178 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 COX7A2P2O60397 106 aa13.1□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 CA1P00915 261 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 RPL7P18124 248 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 OPCMLQ14982 345 aa13.1□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 SAMD13Q5VXD3 122 aa13.1□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 LINC00305Q7Z4B0 112 aa13.1□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 OR11H7Q8NGC8 314 aa13.1□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 CHAC2Q8WUX2 184 aa13.1□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM37Q8WXS4 190 aa13.1□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 LINC00052Q96N35 136 aa13.1□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 MBD2Q9UBB5 411 aa13.1□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 ISLRO14498 428 aa13.09□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 RPL29P47914 159 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 B2MP61769 119 aa13.09□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 CLINT1Q14677 625 aa13.09□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 OXA1LQ15070 435 aa13.09□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 Q6ZRG5 221 aa13.09□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 MUC7Q8TAX7 377 aa13.09□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 C16orf92Q96LL3 132 aa13.09□□□□□ -0.31
UBE2Q1-207ENST00000497453 MPDU1O75352 247 aa13.08□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 LYL1P12980 280 aa13.08□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 RPL12P30050 165 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 DEFB1P60022 68 aa13.08□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 C10orf113Q5VZT2 155 aa13.08□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 THAP6Q8TBB0 222 aa13.08□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 NPCDR1Q9BY65 106 aa13.08□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa13.08□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC39A9Q9NUM3 307 aa13.08□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 RNF24Q9Y225 148 aa13.08□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 HSPB11Q9Y547 144 aa13.08□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 H3BMM0 161 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 SPP1P10451 314 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 MORN5Q5VZ52 161 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 OR1L4Q8NGR5 311 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 C20orf173Q96LM9 149 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 PXMP4Q9Y6I8 212 aa13.07□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 A0A087X0K7 114 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 C3orf84H3BNL1 204 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 HLA-DRB4P13762 266 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 C4BPBP20851 252 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 FGL1Q08830 312 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 GDF5OSQ5U4N7 250 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 FOXI2Q6ZQN5 318 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 GATAD1Q8WUU5 269 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 PFDN5Q99471 154 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 ATP5SQ99766 215 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa13.06□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa13.05□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGFL4Q6B9Z1 124 aa13.05□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 RPRMQ9NS64 109 aa13.05□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM41BQ5BJD5 291 aa13.04□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa13.04□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 SMIM3Q9BZL3 60 aa13.04□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRAV5A0A0B4J249 113 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 F6UB75 175 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 GIPP09681 153 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 EBLN2Q6P2I7 272 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 RNF182Q8N6D2 247 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 RARRES2Q99969 163 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 AGRNO00468 2067 aa13.03□□□□□ -0.32
UBE2Q1-207ENST00000497453 A0A0J9YWU9 116 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 A0A0J9YX75 114 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGKV3-20P01619 116 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 Q5BKY6 102 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 GCSAMLQ5JQS6 135 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF709Q8N972 641 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 OR11H2Q8NH07 326 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 LRRC20Q8TCA0 184 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 ASB13Q8WXK3 278 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 WFDC1Q9HC57 220 aa13.02□□□□□ -0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 C17orf112F2Z3M2 114 aa13.01□□□□□ -0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 CXCL2P19875 107 aa13.01□□□□□ -0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 HLA-DMBP28068 263 aa13.01□□□□□ -0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 CASC10Q5T4H9 136 aa13.01□□□□□ -0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 OR4B1Q8NGF8 309 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.9 ms