RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 FXYD5Q96DB9 178 aa8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 ESM1Q9NQ30 184 aa8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 RABAC1Q9UI14 185 aa8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.28□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF98A6NK75 572 aa8.28□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 SNAPINO95295 136 aa8.28□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 GP9P14770 177 aa8.28□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 ATP5G3P48201 142 aa8.28□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 CEBPGP53567 150 aa8.28□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 PRR31Q5SQ13 230 aa8.28□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.28□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 RNF152Q8N8N0 203 aa8.28□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.28□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.28□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.28□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 PPP5D1E7EU14 171 aa8.27□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV3-11P01762 117 aa8.27□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.27□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 HILS1P60008 231 aa8.27□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.27□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 LEMD1Q68G75 181 aa8.27□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.27□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.27□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 Q6ZSV7 163 aa8.27□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.27□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.27□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 JMJD8Q96S16 334 aa8.27□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.26□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 NDUFA4O00483 81 aa8.26□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 GGCTO75223 188 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 TRBV12-3P01733 135 aa8.26□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 CRYBA1P05813 215 aa8.26□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.26□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.26□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 C11orf52Q96A22 123 aa8.26□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF727A8MUV8 499 aa8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 H3BQ15 152 aa8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 NPPCP23582 126 aa8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 TVP23CQ96ET8 276 aa8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 METTL26Q96S19 204 aa8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 SMIM7Q9BQ49 75 aa8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 PARLQ9H300 379 aa8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 C16orf95Q9H693 158 aa8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 U3KQE9 123 aa8.25□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 GGTLC3B5MD39 225 aa8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 SCO1O75880 301 aa8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 NDUFB4O95168 129 aa8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLC2P0DOY2 106 aa8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 CRYBB3P26998 211 aa8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 MYCNOSP40205 109 aa8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 DEFA6Q01524 100 aa8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 BLNKQ8WV28 456 aa8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 GPR82Q96P67 336 aa8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 ELOVL1Q9BW60 279 aa8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 NAT8Q9UHE5 227 aa8.24□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.23□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.23□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 M0R036 132 aa8.23□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 BUB3O43684 328 aa8.23□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 RANP62826 216 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.23□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 AWAT1Q58HT5 328 aa8.23□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 GPHB5Q86YW7 130 aa8.23□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.23□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.23□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.23□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 Q9H3A6 140 aa8.23□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 OTORQ9NRC9 128 aa8.23□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 PGPA6NDG6 321 aa8.22□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 NDUFA7O95182 113 aa8.22□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 PDE6HQ13956 83 aa8.22□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 RHEBQ15382 184 aa8.22□□□□□ -1.09
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms