RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRAV10A0A0B4J240 114 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A0A0J9YX75 114 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 H3BRN7 92 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 L7N2F9 121 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LINC00869P0C866 280 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 VAMP2P63027 116 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TEPPQ6URK8 271 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C17orf77Q96MU5 243 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC32Q9BV29 185 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC35B3Q9H1N7 401 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NUDT15Q9NV35 164 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CELA1Q9UNI1 258 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C7orf66A4D0T2 115 aa13.89□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C5orf51A6NDU8 294 aa13.89□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FNDC10F2Z333 226 aa13.89□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DEDDO75618 318 aa13.89□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGFL4Q6B9Z1 124 aa13.89□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF767PQ75MW2 155 aa13.89□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 S100A7AQ86SG5 101 aa13.89□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF709Q8N972 641 aa13.89□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NEU1Q99519 415 aa13.89□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SEC22CQ9BRL7 303 aa13.89□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARL6Q9H0F7 186 aa13.89□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SMIM9A6NGZ8 99 aa13.88□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 H2AFB2P0C5Z0 115 aa13.88□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RPL7P18124 248 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BCAP31P51572 246 aa13.88□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EMP1P54849 157 aa13.88□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PLP1P60201 277 aa13.88□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC38A11Q08AI6 406 aa13.88□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C12orf74Q32Q52 190 aa13.88□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UHRF2Q96PU4 802 aa13.88□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 APLNQ9ULZ1 77 aa13.88□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa13.88□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GOSR2O14653 212 aa13.87□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARL16Q0P5N6 197 aa13.87□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GGACTQ9BVM4 153 aa13.87□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa13.86□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa13.86□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM189A5PLL7 270 aa13.86□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNF182Q8N6D2 247 aa13.86□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LRRC20Q8TCA0 184 aa13.86□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RFNGQ9Y644 331 aa13.86□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 K7EPK0 472 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AGPAT2O15120 278 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPART-AS1P0CW21 52 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MZT2BQ6NZ67 158 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PATE2Q6UY27 113 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF546Q86UE3 836 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C2orf50Q96LR7 162 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARV1Q9H2C2 271 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNF24Q9Y225 148 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CAV2P51636 162 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CNN1P51911 297 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PXDC1Q5TGL8 231 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LINC00299Q6ZSB3 139 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C1orf158Q8N1D5 194 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF738Q8NE65 137 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 S100ZQ8WXG8 99 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HBE1P02100 147 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM208Q9BTX3 173 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNF126Q9BV68 326 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KMT2AQ03164 3969 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BIRC6Q9NR09 4857 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM24AA6NFZ4 105 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A8MTW9 85 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 COX7A2P2O60397 106 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CST7O76096 145 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 S100A10P60903 97 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRR20EP86478 221 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRR20CP86479 221 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRR20DP86480 221 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRR20BP86481 221 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRR20AP86496 221 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RAB31Q13636 194 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AMTNQ6UX39 209 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LINC00305Q7Z4B0 112 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR11H7Q8NGC8 314 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MGST2Q99735 147 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A0A087X0K7 114 aa13.81□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AMBPP02760 352 aa13.81□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPINK13Q1W4C9 94 aa13.81□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RRN3P1Q2M238 152 aa13.81□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa13.8□□□□□ -0.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 M0R2Z0 102 aa13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms