RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	RNF182	Q8N6D2	247 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ATG4B-223	ENST00000493618	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ATG4B-223	ENST00000493618	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ATG4B-223	ENST00000493618	DNAH2	Q9P225	4427 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ATG4B-223	ENST00000493618	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ATG4B-223	ENST00000493618	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ATG4B-223	ENST00000493618		H3BRN7	92 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
ATG4B-223	ENST00000493618	IL5	P05113	134 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ATG4B-223	ENST00000493618	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ATG4B-223	ENST00000493618	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ATG4B-223	ENST00000493618	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
ATG4B-223	ENST00000493618	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ATG4B-223	ENST00000493618	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM189	A5PLL7	270 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	PRM2	P04554	102 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	OR5G3	P0C626	314 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	LINC00869	P0C866	280 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	HTN3	P15516	51 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	AMTN	Q6UX39	209 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	SMIM8	Q96KF7	97 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	UHRF2	Q96PU4	802 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	DKK2	Q9UBU2	259 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	CENPX	A8MT69	81 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618		M0R2Z0	102 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	HYPM	O75409	117 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	HBE1	P02100	147 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	IL7	P13232	177 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	RAP2B	P61225	183 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	GPR82	Q96P67	336 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618		M0R2N4	97 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	CCS	O14618	274 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	DLK1	P80370	383 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	RRN3P1	Q2M238	152 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF738	Q8NE65	137 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	ARL6	Q9H0F7	186 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618		A8MTW9	85 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618		P0DMU3	169 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM231A	P0DMU4	169 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM231C	P0DMU5	169 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	S100A7	P31151	101 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	ARL16	Q0P5N6	197 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	PATE2	Q6UY27	113 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	BAP18	Q8IXM2	172 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	PLP1	P60201	277 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	MITD1	Q8WV92	249 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	HERC2	O95714	4834 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	NACA	E9PAV3	2078 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	PLA2G10	O15496	165 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	TSC22D2	O75157	780 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	INS	P01308	110 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	DAD1	P61803	113 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	SELENOT	P62341	195 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	TEPP	Q6URK8	271 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	ARV1	Q9H2C2	271 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ATG4B-223	ENST00000493618	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ATG4B-223	ENST00000493618	C7orf66	A4D0T2	115 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM25E	A8MYX2	175 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ATG4B-223	ENST00000493618	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ATG4B-223	ENST00000493618	AGPAT2	O15120	278 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ATG4B-223	ENST00000493618	RHOB	P62745	196 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ATG4B-223	ENST00000493618	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ATG4B-223	ENST00000493618	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
ATG4B-223	ENST00000493618	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		10.38	□□□□□ -0.75

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