RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491160.1

PBX3-208, Transcript of PBX homeobox 3, human

TSL 5

Gene PBX3, Length 679 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PBX3-208	ENST00000491160	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	DEFB125	Q8N687	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	RHOV	Q96L33	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	BET1L	Q9NYM9	111 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160		A0A1W2PPV4	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	COLCA2	A8K830	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	NBR2	O15453	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	KBTBD11	O94819	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	OPRK1	P41145	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CD81	P60033	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CX3CL1	P78423	397 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	RAB31	Q13636	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160		A0A087WWC5	75 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160		B4DEV8	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160		H0YJW9	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	RRH	O14718	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	CNIH1	O95406	144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	MT-CO2	P00403	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	CA2	P00918	260 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	TRGV3	P03979	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	S100A6	P06703	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	CSN3	P07498	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	CD7	P09564	240 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	RAB5A	P20339	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	AKR1D1	P51857	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	ZNF137P	P52743	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	B2M	P61769	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	RNF212	Q495C1	297 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	NPB	Q8NG41	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	MGST2	Q99735	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160		F6UZH7	168 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	NDUFA3	O95167	84 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	MYOD1	P15172	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	RHOB	P62745	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PBX3-208	ENST00000491160	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms