RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489842.1

GTF3C5-210, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene GTF3C5, Length 696 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-210ENST00000489842 TCTAP57738 103 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 KIR3DS1Q14943 382 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 PATE2Q6UY27 113 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 BAP18Q8IXM2 172 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 NEU1Q99519 415 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 PSENENQ9NZ42 101 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 RFNGQ9Y644 331 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 H3BRN7 92 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 ISLRO14498 428 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 MED6O75586 246 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC25A6P12236 298 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 S100A5P33763 92 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 AP3S2P59780 193 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 ID3Q02535 119 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 MORN5Q5VZ52 161 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 RPRMQ9NS64 109 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 A8MTW9 85 aa6.44□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 NDUFB6O95139 128 aa6.44□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 HBE1P02100 147 aa6.44□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 IL5P05113 134 aa6.44□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 OR5G3P0C626 314 aa6.44□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 OR4E1P0C645 316 aa6.44□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 GALR1P47211 349 aa6.44□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF738Q8NE65 137 aa6.44□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.44□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.44□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.44□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 HSPG2P98160 4391 aa6.44□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 PRAC2D3DTV9 90 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 FABP1P07148 127 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 LINC00869P0C866 280 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 DEFB130BP0DP73 79 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 DEFB130AP0DP74 79 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 HTN1P15515 57 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 RRN3P1Q2M238 152 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 ARL6Q9H0F7 186 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 PLA2G10O15496 165 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 HYPMO75409 117 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 P0DMU3 169 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 FAM231AP0DMU4 169 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 FAM231CP0DMU5 169 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 INPP1P49441 399 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 DAD1P61803 113 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 RHOBP62745 196 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 C4orf46Q504U0 113 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 TRIQKQ629K1 86 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF575Q86XF7 245 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 SMIM8Q96KF7 97 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 TMEM189A5PLL7 270 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 J3KRW8 73 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC17A3O00476 420 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 IL7P13232 177 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 CXCL3P19876 107 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.8 ms