RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489100.5

FAM107B-223, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-223	ENST00000489100	HOXB5	P09067	269 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	FXYD7	P58549	80 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	RRN3P1	Q2M238	152 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	LINC00052	Q96N35	136 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	SRR	Q9GZT4	340 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	DKK2	Q9UBU2	259 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	PRSS46	E5RG02	174 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100		F5H768	121 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	SOCS3	O14543	225 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	NDUFB6	O95139	128 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	DEFB130B	P0DP73	79 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	DEFB130A	P0DP74	79 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	GALR1	P47211	349 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	DLK1	P80370	383 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	AKR1C1	Q04828	323 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	OR2F1	Q13607	317 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	GPR82	Q96P67	336 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	NEU1	Q99519	415 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-223	ENST00000489100	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	C9orf170	A2RU37	121 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	CENPX	A8MT69	81 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100		H3BP45	60 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	ADAP1	O75689	374 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	IFNA5	P01569	189 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	PAX9	P55771	341 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	OXA1L	Q15070	435 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	S100A7A	Q86SG5	101 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	C16orf92	Q96LL3	132 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	SLC25A22	Q9H936	323 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	RPRM	Q9NS64	109 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100		A0A0J9YX75	114 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	SMCO3	A2RU48	225 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF98	A6NK75	572 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	SSSCA1	O60232	199 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	OR4E1	P0C645	316 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	ORM2	P19652	201 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	RAP2B	P61225	183 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	SELENOT	P62341	195 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	PSG9	Q00887	426 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	ID3	Q02535	119 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	BAK1	Q16611	211 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	C4orf46	Q504U0	113 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF709	Q8N972	641 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	C18orf15	Q96N68	181 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	DOK5	Q9P104	306 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	RNF24	Q9Y225	148 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	HERC1	Q15751	4861 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100		A8MTW9	85 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	FNDC10	F2Z333	226 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM229A	H3BQW9	127 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100		H3BRN7	92 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	TSC22D2	O75157	780 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	IL5	P05113	134 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	ATP5G1	P05496	136 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	IL7	P13232	177 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	ATP5G3	P48201	142 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	TAS2R30	P59541	319 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	DEFB1	P60022	68 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100		Q5VSD8	79 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM78B	Q5VT40	261 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	SSX7	Q7RTT5	188 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	SMIM8	Q96KF7	97 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	RSG1	Q9BU20	258 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-223	ENST00000489100	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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