RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 PKD1P98161 4303 aa15.7■□□□□ 0.1
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PTPRN-215ENST00000484986 WRBO00258 174 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRN-215ENST00000484986 AKR1C1Q04828 323 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRN-215ENST00000484986 PYDC2Q56P42 97 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRN-215ENST00000484986 TMEM88Q6PEY1 159 aa15.69■□□□□ 0.1
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PTPRN-215ENST00000484986 GSG1LQ6UXU4 331 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRN-215ENST00000484986 C15orf53Q8NAA6 179 aa15.69■□□□□ 0.1
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PTPRN-215ENST00000484986 S100A5P33763 92 aa15.63■□□□□ 0.09
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PTPRN-215ENST00000484986 F5H768 121 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRN-215ENST00000484986 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRN-215ENST00000484986 OR8A1Q8NGG7 326 aa15.58■□□□□ 0.08
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PTPRN-215ENST00000484986 LINC01587Q99440 93 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRN-215ENST00000484986 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN-215ENST00000484986 C9orf170A2RU37 121 aa15.57■□□□□ 0.08
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PTPRN-215ENST00000484986 C16orf74Q96GX8 76 aa15.56■□□□□ 0.08
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PTPRN-215ENST00000484986 NPVFQ9HCQ7 196 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN-215ENST00000484986 PLAC8L1A1L4L8 177 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN-215ENST00000484986 PMS2P5A8MQ11 134 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN-215ENST00000484986 K7EPK0 472 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN-215ENST00000484986 NUDT3O95989 172 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN-215ENST00000484986 AZU1P20160 251 aa15.55■□□□□ 0.08
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