RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 HSD52Q0P140 79 aa13.07□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa13.07□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 FAM106CPP0CH98 169 aa13.06□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 FAM106AQ4KMX7 169 aa13.06□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa13.06□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 H3BRM9 83 aa13.06□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 FAM215AQ9Y5M1 114 aa13.06□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 AKAP6Q13023 2319 aa13.06□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 C15orf65H3BRN8 121 aa13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ENSAO43768 121 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 CT45A1Q5HYN5 189 aa13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 CT45A3Q8NHU0 189 aa13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 HARBI1Q96MB7 349 aa13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 C1RLQ9NZP8 487 aa13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 J3QR89 54 aa13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM13P0DJ93 91 aa13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 JPT1Q9UK76 154 aa13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 TM4SF5O14894 197 aa13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 CD69Q07108 199 aa13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PPM0 123 aa13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SRRM5B3KS81 715 aa13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ETDBQ3ZM63 59 aa13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SFTA2Q6UW10 78 aa13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV1-44P01699 117 aa13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 CFHR2P36980 270 aa13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 RAB9AP51151 201 aa13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 LCNL1Q6ZST4 164 aa13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM14BQ9NUH8 114 aa13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 MGST3O14880 152 aa13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 PRSS1P07477 247 aa13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 CKS1BP61024 79 aa13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF414Q96IQ9 312 aa13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF747Q9BV97 191 aa13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 KIR2DS2P43631 304 aa13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 AMTNQ6UX39 209 aa13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 FAM231DQ6ZW35 169 aa13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 LYZP61626 148 aa13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SCGB2A2Q13296 93 aa13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 FAM90A1Q86YD7 464 aa13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GUT8 65 aa13.02□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 CEACAM3P40198 252 aa13.02□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa13.02□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 C19orf24Q9BVV8 132 aa13.02□□□□□ -0.32
CCSAP-204ENST00000483092 K7EQM0 130 aa13.02□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CRXO43186 299 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PRCDQ00LT1 54 aa13.02□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 OR5A1Q8NGJ0 315 aa13.02□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 IGFL2Q6UWQ7 119 aa13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PRR7Q8TB68 274 aa13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 LRBAP50851 2863 aa13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFS8O00217 210 aa13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 WFDC2Q14508 124 aa13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01545Q5VT33 79 aa13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GXF2 115 aa13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 GAGE12HA6NDE8 117 aa13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SMKR1H3BMG3 65 aa13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 F2RL2O00254 374 aa13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 UPK2O00526 184 aa13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 RIGQ13278 110 aa13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 Q71RC1 249 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 Q9H3A6 140 aa13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 DSCAML1Q8TD84 2053 aa13□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa13□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 UFSP1Q6NVU6 142 aa13□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CCL17Q92583 94 aa13□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 DLL1O00548 723 aa13□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 D6R8Y8 96 aa13□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A17O43808 307 aa13□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PPIFP30405 207 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 GLRXP35754 106 aa13□□□□□ -0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MZT1Q08AG7 82 aa13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.8 ms