RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476784.5

TTC3-215, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTC3, Length 7,425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-215ENST00000476784 hDV102S1A0JD36 115 aa5.46□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa5.46□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 TJP1Q07157 1748 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 RAMP3O60896 148 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 DPM2O94777 84 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 Q6AWC8 147 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 ERG28Q9UKR5 140 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 F2Z2F3 143 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 NDUFAF3Q9BU61 184 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 SCN4AP35499 1836 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 CREBBPQ92793 2442 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 LAGE3Q14657 143 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 A8MXK9 166 aa5.45□□□□□ -1.54
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TTC3-215ENST00000476784 ATP5G3P48201 142 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 SLAQ13239 276 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 NIT1Q86X76 327 aa5.45□□□□□ -1.54
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TTC3-215ENST00000476784 RPRMLQ8N4K4 120 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 EPDR1Q9UM22 224 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 C4orf51C9J302 202 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 IMMP2LQ96T52 175 aa5.45□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
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TTC3-215ENST00000476784 TMEM238C9JI98 176 aa5.44□□□□□ -1.54
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TTC3-215ENST00000476784 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.44□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.44□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.44□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 C14orf144Q96I85 54 aa5.44□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.44□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 PLCE1Q9P212 2302 aa5.44□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 MESP1Q9BRJ9 268 aa5.44□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 VPREB3Q9UKI3 123 aa5.44□□□□□ -1.54
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TTC3-215ENST00000476784 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 OXLD1Q5BKU9 147 aa5.44□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.44□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 IL36BQ9NZH7 164 aa5.44□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 TAF1LQ8IZX4 1826 aa5.44□□□□□ -1.54
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TTC3-215ENST00000476784 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa5.44□□□□□ -1.54
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TTC3-215ENST00000476784 SIGLEC9Q9Y336 463 aa5.43□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa5.43□□□□□ -1.54
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TTC3-215ENST00000476784 CHD5Q8TDI0 1954 aa5.43□□□□□ -1.54
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TTC3-215ENST00000476784 WBP1Q96G27 269 aa5.43□□□□□ -1.54
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TTC3-215ENST00000476784 CLDN16Q9Y5I7 305 aa5.43□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa5.43□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 CRYGCP07315 174 aa5.43□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 PRTN3P24158 256 aa5.43□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 HEPN1Q6WQI6 88 aa5.43□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 LIME1Q9H400 295 aa5.43□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 A0A1B0GW15 77 aa5.42□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.42□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
TTC3-215ENST00000476784 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa5.42□□□□□ -1.54
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