RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.84□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 C6orf223Q8N319 242 aa7.84□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 ZNF738Q8NE65 137 aa7.84□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.84□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 FAT1Q14517 4588 aa7.83□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 CTDSPLO15194 276 aa7.83□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 FABP1P07148 127 aa7.83□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 VAMP1P23763 118 aa7.83□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 KIR3DS1Q14943 382 aa7.83□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.83□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.83□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 RNF141Q8WVD5 230 aa7.83□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.83□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 LYRM9A8MSI8 78 aa7.82□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 CCNKO75909 580 aa7.82□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 HOXB5P09067 269 aa7.82□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.82□□□□□ -1.166e-7■■■□□ 15.9
ACTB-209ENST00000473257 ALDH3B2P48448 385 aa7.82□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 MEOX2P50222 304 aa7.82□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 RAB11AP62491 216 aa7.82□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 RHOBP62745 196 aa7.82□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 DLK1P80370 383 aa7.82□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 AKR1C1Q04828 323 aa7.82□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa7.82□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 GPR141Q7Z602 305 aa7.82□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.82□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.82□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 LINC01587Q99440 93 aa7.82□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.82□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 A0A0J9YY99 117 aa7.81□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 SMCO3A2RU48 225 aa7.81□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 H3BRN7 92 aa7.81□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 H3BTX0 84 aa7.81□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.81□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 ANXA3P12429 323 aa7.81□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 TNFSF8P32971 234 aa7.81□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP10-2P60368 255 aa7.81□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.81□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 BPIFCQ8NFQ6 507 aa7.81□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 SOSTQ9BQB4 213 aa7.81□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.81□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 SYNGR2O43760 224 aa7.8□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 CDK2AP2O75956 126 aa7.8□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 SRPXP78539 464 aa7.8□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 PPP1R1AQ13522 171 aa7.8□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 SSX7Q7RTT5 188 aa7.8□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.8□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 SCGB3A2Q96PL1 93 aa7.8□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.8□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.8□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 FABP12A6NFH5 140 aa7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 CBY3A6NI87 242 aa7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 PRAC2D3DTV9 90 aa7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 ADAP1O75689 374 aa7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 ATP5G1P05496 136 aa7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 OR5G3P0C626 314 aa7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 CXCL3P19876 107 aa7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 ATP5G3P48201 142 aa7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 OR5I1Q13606 314 aa7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 CLINT1Q14677 625 aa7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 PATE2Q6UY27 113 aa7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 TRIM63Q969Q1 353 aa7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.79□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 J3KRW8 73 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 HYPMO75409 117 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 SFT2D2O95562 160 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 IL5P05113 134 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 LINC00869P0C866 280 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 HOXA5P20719 270 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 TSPOP30536 169 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 CCL18P55774 89 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 PSG3Q16557 428 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 PYDC2Q56P42 97 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
ACTB-209ENST00000473257 GAGE12BA1L429 117 aa7.77□□□□□ -1.17
ACTB-209ENST00000473257 SSSCA1O60232 199 aa7.77□□□□□ -1.17
ACTB-209ENST00000473257 MED6O75586 246 aa7.77□□□□□ -1.17
ACTB-209ENST00000473257 GAGE7O76087 117 aa7.77□□□□□ -1.17
ACTB-209ENST00000473257 CFDP00746 253 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
ACTB-209ENST00000473257 GAGE12FP0CL80 117 aa7.77□□□□□ -1.17
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