RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	COX7A2P2	O60397	106 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	PRAF2	O60831	178 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	DEDD	O75618	318 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	JTB	O76095	146 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	RLN2	P04090	185 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	BAX	Q07812	192 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	GGACT	Q9BVM4	153 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	RPRM	Q9NS64	109 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880		F6UB75	175 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880		H3BMM0	161 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	HLA-DRB4	P13762	266 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	CAMLG	P49069	296 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	HBG1	P69891	147 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	HBG2	P69892	147 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	ARV1	Q9H2C2	271 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	LCE6A	A0A183	80 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	IGSF23	A1L1A6	192 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	NUPR2	A6NF83	97 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	SULT1A1	P50225	295 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	MGST2	Q99735	147 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	SOCS3	O14543	225 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	FGF7	P21781	194 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	S100A11	P31949	105 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZRG5	221 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	RNF182	Q8N6D2	247 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF738	Q8NE65	137 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	C20orf173	Q96LM9	149 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SSR4-208	ENST00000471880	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	PLP1	P60201	277 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	FAM78B	Q5VT40	261 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	MIC13	Q5XKP0	118 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	MFF	Q9GZY8	342 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	RNF24	Q9Y225	148 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	MIF	P14174	115 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	PATE2	Q6UY27	113 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	NMES1	Q9C002	83 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0J9YX75	114 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880		E5RGE8	158 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880		H3BTX0	84 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	PSG9	Q00887	426 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	NHLH2	Q02577	135 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	IL15RA	Q13261	267 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	CLINT1	Q14677	625 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	ATP6V1F	Q16864	119 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880		Q8NAQ8	132 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	HLA-DMB	P28068	263 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	EMP1	P54849	157 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	B2M	P61769	119 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	RHOB	P62745	196 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	THAP6	Q8TBB0	222 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	LYST	Q99698	3801 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		10.74	□□□□□ -0.69

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