RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466346.1

MRPL23-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, human

TSL 2

Gene MRPL23, Length 736 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL23-208	ENST00000466346	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	PATE2	Q6UY27	113 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	NRN1	Q9NPD7	142 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	BCL2L11	O43521	198 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	MEOX2	P50222	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	CXCL2	P19875	107 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	TFPI2	P48307	235 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	DEFA6	Q01524	100 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	LEMD1	Q68G75	181 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	C4BPB	P20851	252 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	ATP6V0C	P27449	155 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	SERF2	P84101	59 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	MB	P02144	154 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	M6PR	P20645	277 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	RHOB	P62745	196 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	FAM78B	Q5VT40	261 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	TMUB2	Q71RG4	321 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	DCANP1	Q8TF63	244 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MRPL23-208	ENST00000466346	OR11H12	B2RN74	326 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346		K7EQG2	157 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	CD7	P09564	240 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	FUT9	Q9Y231	359 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346		A0A087X0K7	114 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346		K7EIL1	84 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	ID1	P41134	155 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	TAS2R45	P59539	299 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	CD300C	Q08708	224 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	MRAP	Q8TCY5	172 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	PSMB3	P49720	205 aa		13.68	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		13.68	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	KHDC3L	Q587J8	217 aa		13.68	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	MORN5	Q5VZ52	161 aa		13.68	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346		Q8N1Y9	231 aa		13.68	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		13.68	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		13.68	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346		A0A1W2PPV4	95 aa		13.67	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	ISLR	O14498	428 aa		13.67	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	RAB2A	P61019	212 aa		13.67	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	GUK1	Q16774	197 aa		13.67	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		13.67	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	LCN15	Q6UWW0	184 aa		13.67	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		13.67	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		13.67	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		13.67	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	ZNF688	P0C7X2	276 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	SPP1	P10451	314 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	STOML3	Q8TAV4	291 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	C16orf92	Q96LL3	132 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	HRH4	Q9H3N8	390 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	TUBA4B	Q9H853	241 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	SOCS3	O14543	225 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	OR7C2	O60412	319 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	IGLC2	P0DOY2	106 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	BAP18	Q8IXM2	172 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346	RFNG	Q9Y644	331 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MRPL23-208	ENST00000466346		A8MZ25	164 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	SEC11B	P0C7V7	166 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	DEFB131A	P59861	70 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MRPL23-208	ENST00000466346	PSMG4	Q5JS54	123 aa		13.64	□□□□□ -0.23

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