RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	MBD2	Q9UBB5	411 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP19-210	ENST00000465902	UBE2C	O00762	179 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP19-210	ENST00000465902	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
USP19-210	ENST00000465902	DEFB135	Q30KP9	77 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP19-210	ENST00000465902	PATE2	Q6UY27	113 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP19-210	ENST00000465902	THAP6	Q8TBB0	222 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP19-210	ENST00000465902	C16orf92	Q96LL3	132 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP19-210	ENST00000465902	CSTL1	Q9H114	145 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP19-210	ENST00000465902	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	MEOX2	P50222	304 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	RNF24	Q9Y225	148 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	MPDU1	O75352	247 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	PSMB3	P49720	205 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	B2M	P61769	119 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	OXA1L	Q15070	435 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902		Q6ZWC4	215 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	HSPB11	Q9Y547	144 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	ISLR	O14498	428 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	SPRY2	O43597	315 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	PRR20E	P86478	221 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	PRR20C	P86479	221 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	PRR20D	P86480	221 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	PRR20B	P86481	221 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	PRR20A	P86496	221 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	OPCML	Q14982	345 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	ZNF709	Q8N972	641 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	PFDN5	Q99471	154 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	ATP5S	Q99766	215 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	SOCS3	O14543	225 aa		13.04	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	DEFB1	P60022	68 aa		13.04	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	RYR3	Q15413	4870 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	IFNA5	P01569	189 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	IGKV3-20	P01619	116 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	LYL1	P12980	280 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	RNF183	Q96D59	192 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	RPRM	Q9NS64	109 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP19-210	ENST00000465902	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	C3orf84	H3BNL1	204 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	SPP1	P10451	314 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	MORN5	Q5VZ52	161 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902		H3BMM0	161 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	RNF182	Q8N6D2	247 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	ASB13	Q8WXK3	278 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	C20orf173	Q96LM9	149 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	C17orf77	Q96MU5	243 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902		A0A087X0K7	114 aa		13	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902		F6UB75	175 aa		13	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	HLA-DRB4	P13762	266 aa		13	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902		Q5BKY6	102 aa		13	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		13	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		13	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	ZNF738	Q8NE65	137 aa		13	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	MUC7	Q8TAX7	377 aa		13	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		13	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902		H3BTX0	84 aa		12.99	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	C4BPB	P20851	252 aa		12.99	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	FAM78B	Q5VT40	261 aa		12.99	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		12.99	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	OR11H2	Q8NH07	326 aa		12.99	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	RARRES2	Q99969	163 aa		12.99	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		12.99	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		12.98	□□□□□ -0.33

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