RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 LEMD1Q68G75 181 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 COMMD7Q86VX2 200 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 RABAC1Q9UI14 185 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 STX12Q86Y82 276 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 STXBP6Q8NFX7 210 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
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C9orf3-210ENST00000462125 SSSCA1O60232 199 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 RAB5CP51148 216 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 CAV2P51636 162 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 RAB11AP62491 216 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 RNF125Q96EQ8 232 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 SMIM8Q96KF7 97 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 RARRES2Q99969 163 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 ARV1Q9H2C2 271 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 ZFP92A6NM28 416 aa9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 PRSS46E5RG02 174 aa9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 SEC11BP0C7V7 166 aa9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF688P0C7X2 276 aa9.66□□□□□ -0.86
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C9orf3-210ENST00000462125 BLOC1S1P78537 153 aa9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF90Q03938 601 aa9.66□□□□□ -0.86
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C9orf3-210ENST00000462125 STHQ8IWL8 128 aa9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 SLC35E1Q96K37 410 aa9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 CA1P00915 261 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 IAPPP10997 89 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 SULT1A1P50225 295 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 HBG1P69891 147 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 HBG2P69892 147 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 THAP8Q8NA92 274 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 OR11H2Q8NH07 326 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 TRGV9Q99603 122 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 MAGT1Q9H0U3 335 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 NRN1Q9NPD7 142 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-210ENST00000462125 IGSF23A1L1A6 192 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 FABP1P07148 127 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 SPP1P10451 314 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 SULT1A2P50226 295 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 UQCC3Q6UW78 93 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 TMED6Q8WW62 240 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 PSENENQ9NZ42 101 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 RAB19A4D1S5 217 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 CXorf65A6NEN9 183 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 NUPR2A6NF83 97 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 KNCNA6PVL3 124 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 UMAD1C9J7I0 102 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 IFNA5P01569 189 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 ATP6V1FQ16864 119 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 ATP5SQ99766 215 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 KRBOX1C9JBD0 128 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 TEX46H3BTG2 121 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 PAX9P55771 341 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 NHLH2Q02577 135 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 PMS2P11Q13670 270 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 PSMG4Q5JS54 123 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 SPANXN5Q5MJ07 72 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 PBDC1Q9BVG4 233 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 AGRNO00468 2067 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 H3BMM0 161 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 SLC45A2Q9UMX9 530 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 SOCS3O14543 225 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 LYZP61626 148 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 TOR2AQ5JU69 321 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 Q8NAQ8 132 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 C11orf45Q8TAV5 145 aa9.6□□□□□ -0.87
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