RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460589.5

RPL3-208, Transcript of ribosomal protein L3, human

TSL 2

Gene RPL3, Length 630 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL3-208	ENST00000460589	C16orf90	A8MZG2	172 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	LINC00052	Q96N35	136 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589		U3KQ87	197 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	ADAP1	O75689	374 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	PSMB3	P49720	205 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	PAX9	P55771	341 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	C17orf77	Q96MU5	243 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	PRM2	P04554	102 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	IL5	P05113	134 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	ZNF90	Q03938	601 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	FAM78B	Q5VT40	261 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	C20orf173	Q96LM9	149 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589		A0A0J9YX75	114 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	SYNGR2	O43760	224 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	HBE1	P02100	147 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	PSG9	Q00887	426 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	AMTN	Q6UX39	209 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589		A8MTW9	85 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	DAD1	P61803	113 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	ID3	Q02535	119 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RPL3-208	ENST00000460589	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	PRAF2	O60831	178 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	ID1	P41134	155 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	GAMT	Q14353	236 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	RRN3P1	Q2M238	152 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	FAT1	Q14517	4588 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	WRB	O00258	174 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	IAPP	P10997	89 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	RAB11A	P62491	216 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	C6orf223	Q8N319	242 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	ISLR	O14498	428 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589		Q8N1X5	172 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	C5orf51	A6NDU8	294 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	ZFP92	A6NM28	416 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	FAM25E	A8MYX2	175 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	LYZ	P61626	148 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	11.92	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	DOK5	Q9P104	306 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	CCS	O14618	274 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	SCGB1D2	O95969	90 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	OR2F1	Q13607	317 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	SMIM8	Q96KF7	97 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	C2orf50	Q96LR7	162 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	ATG101	Q9BSB4	218 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589		M0R2Z0	102 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	SSSCA1	O60232	199 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	PTTG1	O95997	202 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	FCN2	Q15485	313 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	SLC35E1	Q96K37	410 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	RPRM	Q9NS64	109 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL3-208	ENST00000460589	LYRM9	A8MSI8	78 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RPL3-208	ENST00000460589	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RPL3-208	ENST00000460589	AZU1	P20160	251 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RPL3-208	ENST00000460589	TAS2R30	P59541	319 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RPL3-208	ENST00000460589	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RPL3-208	ENST00000460589	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RPL3-208	ENST00000460589	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		11.89	□□□□□ -0.51

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