RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428007.1

PAICSP3-201, Transcript of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide synthetase pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene PAICSP3, Length 1,168 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAICSP3-201ENST00000428007 ORM2P19652 201 aa6.64□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 PSMB3P49720 205 aa6.64□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 H2BFSP57053 126 aa6.64□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNF90Q03938 601 aa6.64□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.64□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.64□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.64□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.64□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.64□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.64□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 ALG5Q9Y673 324 aa6.64□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.63□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 CST7O76096 145 aa6.63□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.63□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.63□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 STHQ8IWL8 128 aa6.63□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.63□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.63□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 U3KQK5 164 aa6.63□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 TAAR5O14804 337 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 COX7A2P2O60397 106 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNF253O75346 499 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 OR5G3P0C626 314 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 MALP21145 153 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 B2MP61769 119 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 OR2F1Q13607 317 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 HAGHQ16775 308 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 DCANP1Q8TF63 244 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 ATP5SQ99766 215 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 CSTL1Q9H114 145 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 ARV1Q9H2C2 271 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 RPRMQ9NS64 109 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 HSPB11Q9Y547 144 aa6.62□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 A0A087X0K7 114 aa6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 IGSF23A1L1A6 192 aa6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 H3BRN7 92 aa6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 SIX6O95475 246 aa6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 MBP02144 154 aa6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 LCN15Q6UWW0 184 aa6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 DEFB125Q8N687 156 aa6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 AQP10Q96PS8 301 aa6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 RNF126Q9BV68 326 aa6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 ARL6Q9H0F7 186 aa6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.61□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 AMBPP02760 352 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 FGF7P21781 194 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 TAS2R45P59539 299 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 SERF2P84101 59 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 NHLH2Q02577 135 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 ARL16Q0P5N6 197 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 PDE6HQ13956 83 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 OPCMLQ14982 345 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 MGST2Q99735 147 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 HRH4Q9H3N8 390 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.6□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.59□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 H0YIZ8 118 aa6.59□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 JTBO76095 146 aa6.59□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 EDN2P20800 178 aa6.59□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 TFPI2P48307 235 aa6.59□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 DEFB131AP59861 70 aa6.59□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 PSG9Q00887 426 aa6.59□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 RCHY1Q96PM5 261 aa6.59□□□□□ -1.35
PAICSP3-201ENST00000428007 RSG1Q9BU20 258 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms