RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 PDLIM4P50479 330 aa15.56■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 MAJINQ3KP22 176 aa15.56■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 THAP8Q8NA92 274 aa15.56■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 C8orf46Q8TAG6 207 aa15.56■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 NRN1Q9NPD7 142 aa15.56■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 VWC2LB2RUY7 222 aa15.55■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 TCRAP04437 139 aa15.55■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 NOTCH3Q9UM47 2321 aa15.55■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 CLEC5AQ9NY25 188 aa15.55■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 IZUMO1RA6ND01 250 aa15.55■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 GNLYP22749 145 aa15.55■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 GPR82Q96P67 336 aa15.55■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 TRGV9Q99603 122 aa15.55■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 VAMP8Q9BV40 100 aa15.55■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa15.54■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 HLA-DMBP28068 263 aa15.54■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM116Q8NCL8 245 aa15.54■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 OR4F17Q8NGA8 305 aa15.54■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 GNB1LQ9BYB4 327 aa15.54■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 BPESC1Q9GZL8 116 aa15.54■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 CUBNO60494 3623 aa15.54■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 A0A1W2PS18 150 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 K7EIM0 57 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 CEACAM3P40198 252 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 TAS2R60P59551 318 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 WDR73Q6P4I2 378 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 I3L2K1 104 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 Q8TAT8 98 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 BORCS7Q96B45 105 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 RNF125Q96EQ8 232 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 CSMD2Q7Z408 3487 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 C19orf84I3L1E1 186 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 CHEK1O14757 476 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 NDUFB8O95169 186 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 GP9P14770 177 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 C5orf17Q8NAS9 161 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 BEND2Q8NDZ0 799 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 PMCHL2Q9BQD1 86 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 J3KRW8 73 aa15.52■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 M0R2Z0 102 aa15.52■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 FSTL3O95633 263 aa15.52■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 BRD3OSQ6XYD6 125 aa15.52■□□□□ 0.08
TTLL3-210ENST00000427220 G3V318 75 aa15.52■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 CRYGBP07316 175 aa15.52■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 GPR183P32249 361 aa15.52■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 ARPC1AQ92747 370 aa15.52■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 FXYD7P58549 80 aa15.51■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 C5orf64Q2M2E5 130 aa15.51■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 FAM71F2Q6NXP2 309 aa15.51■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 GRAMD2BQ96HH9 432 aa15.51■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 PTPN13Q12923 2485 aa15.51■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 LINC01548A6NM66 108 aa15.51■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 HLA-DQA1P01909 254 aa15.51■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 STXBP6Q8NFX7 210 aa15.51■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa15.51■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa15.51■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 GPX1P07203 203 aa15.51■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa15.51■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 TP73-AS1Q9UF72 201 aa15.51■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 CELSR2Q9HCU4 2923 aa15.5■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 C8orf49Q96NF6 230 aa15.5■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 LY96Q9Y6Y9 160 aa15.5■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 SONP18583 2426 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 CRYGCP07315 174 aa15.5■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM183BQ1AE95 376 aa15.5■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa15.5■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 GTSF1Q8WW33 167 aa15.5■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 HLA-DRB1P01911 266 aa15.49■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 LY6EQ16553 131 aa15.49■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 TSKUQ8WUA8 353 aa15.49■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 TNFRSF14Q92956 283 aa15.49■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC168Q8NDH2 2452 aa15.49■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa15.49■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 CHODLQ9H9P2 273 aa15.49■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 SORL1Q92673 2214 aa15.49■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 C18orf32Q8TCD1 76 aa15.49■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 NDUFAF3Q9BU61 184 aa15.49■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 EPG5Q9HCE0 2579 aa15.48■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 PPIFP30405 207 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF491Q8N8L2 437 aa15.48■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 C8orf31Q8N9H6 132 aa15.48■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 CHRDL1Q9BU40 450 aa15.48■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 C21orf62Q9NYP8 219 aa15.48■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF462Q96JM2 2506 aa15.48■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 C3orf79P0CE67 100 aa15.47■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 PAFAH1B2P68402 229 aa15.47■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 PRTN3P24158 256 aa15.47■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 TFPI2P48307 235 aa15.47■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 UCNP55089 124 aa15.47■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 SSX8Q7RTT4 187 aa15.47■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 KCNS1Q96KK3 526 aa15.47■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 SNHG12Q9BXW3 62 aa15.47■□□□□ 0.07
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms