RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423693.5

HDLBP-210, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-210ENST00000423693 UHRF2Q96PU4 802 aa9.62□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 SCRT1Q9BWW7 348 aa9.62□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.62□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 SLC25A32Q9H2D1 315 aa9.62□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 SLC25A22Q9H936 323 aa9.62□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.62□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 UBQLN2Q9UHD9 624 aa9.62□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.61□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 G3V3Q6 166 aa9.61□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 RSG1Q9BU20 258 aa9.61□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.61□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 WFDC1Q9HC57 220 aa9.61□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 ISLRO14498 428 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 PSMB3P49720 205 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 DEFB131AP59861 70 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 LEMD1Q68G75 181 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 FAM24BQ8N5W8 94 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 A0A087X0K7 114 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 RNF222A6NCQ9 220 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 HMSDA8MTL9 139 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 SOCS3O14543 225 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 TAAR5O14804 337 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF688P0C7X2 276 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 CXCL2P19875 107 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 APOC4P55056 127 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 HAGHQ16775 308 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 CITED4Q96RK1 184 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-210ENST00000423693 UBE2CO00762 179 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF345Q14585 488 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 PSMG4Q5JS54 123 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 C16orf92Q96LL3 132 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 ZMAT4Q9H898 229 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 ARPC5O15511 151 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 GUK1Q16774 197 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 FAM78BQ5VT40 261 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 C17orf77Q96MU5 243 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 ASCL2Q99929 193 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 SPATA25Q9BR10 227 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 MFFQ9GZY8 342 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 HRH4Q9H3N8 390 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 JTBO76095 146 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 RHOBP62745 196 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 SERF2P84101 59 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 MORN5Q5VZ52 161 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 LCN15Q6UWW0 184 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 STHQ8IWL8 128 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 TCTE3Q8IZS6 198 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 FUT9Q9Y231 359 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 A0A0D9SG52 128 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 SMLR1H3BR10 107 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF253O75346 499 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 MBP02144 154 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 IGLC2P0DOY2 106 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 M6PRP20645 277 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF124Q15973 351 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 Q6ZWC4 215 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 ST6GAL2Q96JF0 529 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 LINC00052Q96N35 136 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 CSTL1Q9H114 145 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 RPRMQ9NS64 109 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 ATP6V0CP27449 155 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 TAS2R45P59539 299 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 PDE6HQ13956 83 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.4 ms