RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417400.1

CITED1-203, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, human

TSL 2

Gene CITED1, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CITED1-203	ENST00000417400	TBP	P20226	339 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	XG	P55808	180 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	TAS2R19	P59542	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SPCS3	P61009	180 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	DLK1	P80370	383 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	MEF2D	Q14814	521 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	GPR132	Q9UNW8	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	RGS5	O15539	181 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	HBE1	P02100	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	HTR2B	P41595	481 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	PAX9	P55771	341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	HAMP	P81172	84 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	PSG9	Q00887	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	ZNF90	Q03938	601 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SPCS2	Q15005	226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400		Q8WTZ3	238 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400		F5H768	121 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	NDUFB4	O95168	129 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	PSMB3	P49720	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400		Q5VSD8	79 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	CTDSPL	O15194	276 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SLC25A4	P12235	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	HOXA5	P20719	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	LYZ	P61626	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	OR2F1	Q13607	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	IL18	Q14116	193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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