RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417004.5

PTPN20-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 20, human

TSL 5

Gene PTPN20, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN20-209	ENST00000417004	ID3	Q02535	119 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	RRN3P1	Q2M238	152 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	FAM210B	Q96KR6	192 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	C17orf77	Q96MU5	243 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	DNAH2	Q9P225	4427 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	SSSCA1	O60232	199 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	NDUFB6	O95139	128 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	IL5	P05113	134 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	RAP2B	P61225	183 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004		A8MTW9	85 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004		H3BRN7	92 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	HTN3	P15516	51 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	FGL1	Q08830	312 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	AMTN	Q6UX39	209 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	HERC2	O95714	4834 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	HYPM	O75409	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	OR4E1	P0C645	316 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	OXA1L	Q15070	435 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	BAK1	Q16611	211 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	RNF182	Q8N6D2	247 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	INS	P01308	110 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	OR5G3	P0C626	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	LINC00869	P0C866	280 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	DAD1	P61803	113 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	SELENOT	P62341	195 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	C4orf46	Q504U0	113 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	ZNF738	Q8NE65	137 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	SMIM8	Q96KF7	97 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPN20-209	ENST00000417004	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	CENPX	A8MT69	81 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004		M0R2N4	97 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004		M0R2Z0	102 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	SCGB1D2	O95969	90 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	DLK1	P80370	383 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	S100A7A	Q86SG5	101 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	CCNK	O75909	580 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	PLP1	P60201	277 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	UHRF2	Q96PU4	802 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	FNDC10	F2Z333	226 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	ARL6	Q9H0F7	186 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	BTC	P35070	178 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	B2M	P61769	119 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	TEPP	Q6URK8	271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	BAP18	Q8IXM2	172 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	RNF24	Q9Y225	148 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004		A0A087X0K7	114 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004		K7EPK0	472 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	TSC22D2	O75157	780 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	TAS2R30	P59541	319 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	RHOB	P62745	196 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	PKHD1	P08F94	4074 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004		A0A1B0GVY2	172 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	LYRM9	A8MSI8	78 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	RTL8C	O15255	209 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPN20-209	ENST00000417004	PRM2	P04554	102 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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