RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 RXFP4Q8TDU9 374 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 NEU1Q99519 415 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM14BQ9NUH8 114 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 A0A096LPF7 62 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2L6O14933 153 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 H2AFB1P0C5Y9 115 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TPT1P13693 172 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 KCNRGQ8N5I3 272 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 GNG13Q9P2W3 67 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 DBX1A6NMT0 343 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV12-3P01733 135 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SULT1A1P50225 295 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 C16orf95Q9H693 158 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-201ENST00000348564 TMEM50AO95807 157 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 CRPP02741 224 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 NBEAP1P0C6P0 100 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 H2BFSP57053 126 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 RND3P61587 244 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS54Q6PEW0 395 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 C8orf31Q8N9H6 132 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 C5orf17Q8NAS9 161 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 OR4C5Q8NGB2 326 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 GPR82Q96P67 336 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TXN2Q99757 166 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SLC50A1Q9BRV3 221 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 OR51M1Q9H341 326 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-201ENST00000348564 NPIPB5A8MRT5 1133 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-201ENST00000348564 C1QBP02746 253 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 HLA-DMBP28068 263 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-201ENST00000348564 LEPP41159 167 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SULT1A2P50226 295 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF56Q15929 161 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM183BQ1AE95 376 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 UTF1Q5T230 341 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TCTE3Q8IZS6 198 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-201ENST00000348564 RETNQ9HD89 108 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM167BQ9NRX6 74 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF98A6NK75 572 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 DEDDO75618 318 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 BRI3O95415 125 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 C8orf88P0DMB2 117 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf87Q6NUJ2 197 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TTC9CQ8N5M4 171 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A32Q9H2D1 315 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 Q9HAA7 133 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PMS2P5A8MQ11 134 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 M0R381 172 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 MPDU1O75352 247 aa3.42□□□□□ -1.86
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PTPRC-201ENST00000348564 OR52E5Q8NH55 327 aa3.42□□□□□ -1.86
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PTPRC-201ENST00000348564 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 M0R2Z0 102 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 MPC2O95563 127 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 AMBPP02760 352 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 CTRB1P17538 263 aa3.42□□□□□ -1.86
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PTPRC-201ENST00000348564 DEFB114Q30KQ6 69 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 CTRB2Q6GPI1 263 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM252Q8N6L7 170 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PRADC1Q9BSG0 188 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 CHCHD5Q9BSY4 110 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFAF3Q9BU61 184 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 WFDC10AQ9H1F0 79 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa3.42□□□□□ -1.86
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