RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A22Q9H936 323 aa9.9□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 NRN1Q9NPD7 142 aa9.9□□□□□ -0.82
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CCDC42-201ENST00000293845 K7EQG2 157 aa9.89□□□□□ -0.83
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CCDC42-201ENST00000293845 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
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CCDC42-201ENST00000293845 TMUB2Q71RG4 321 aa9.89□□□□□ -0.83
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CCDC42-201ENST00000293845 MEOX2P50222 304 aa9.88□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.88□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.88□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 C9orf62Q8N4C0 152 aa9.88□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 C17orf77Q96MU5 243 aa9.88□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 FUT9Q9Y231 359 aa9.88□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 SOCS3O14543 225 aa9.87□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 MBP02144 154 aa9.87□□□□□ -0.83
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CCDC42-201ENST00000293845 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
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CCDC42-201ENST00000293845 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.87□□□□□ -0.83
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CCDC42-201ENST00000293845 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.87□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 STOML3Q8TAV4 291 aa9.87□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.87□□□□□ -0.83
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CCDC42-201ENST00000293845 FAM24BQ8N5W8 94 aa9.86□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.86□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.86□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.86□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 A8MZ25 164 aa9.85□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 SEC11BP0C7V7 166 aa9.85□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 TPT1P13693 172 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 BAP18Q8IXM2 172 aa9.85□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 OR10G4Q8NGN3 311 aa9.85□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.85□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.85□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 HRH4Q9H3N8 390 aa9.85□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 AGRNO00468 2067 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 OR11H12B2RN74 326 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 ISLRO14498 428 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF688P0C7X2 276 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 C4BPBP20851 252 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 PSMB3P49720 205 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 TAS2R45P59539 299 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 LCN15Q6UWW0 184 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 MRAPQ8TCY5 172 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 RPRMQ9NS64 109 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 UBQLN2Q9UHD9 624 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1W2PPV4 95 aa9.83□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 H3BQ15 152 aa9.83□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.83□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 ID1P41134 155 aa9.83□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 GUK1Q16774 197 aa9.83□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 KHDC3LQ587J8 217 aa9.83□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 FAM122CQ6P4D5 195 aa9.83□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 SLC51BQ86UW2 128 aa9.83□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 DEFB125Q8N687 156 aa9.83□□□□□ -0.84
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