RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 ERASQ7Z444 233 aa11.87□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.87□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa11.87□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 ZNF785A8K8V0 405 aa11.87□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 TAX1BP3O14907 124 aa11.87□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 TOX4O94842 621 aa11.87□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 PSG1P11464 419 aa11.87□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 PAX2Q02962 417 aa11.87□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 PET117Q6UWS5 81 aa11.87□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa11.87□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 OR4C5Q8NGB2 326 aa11.87□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 VAMP3Q15836 100 aa11.86□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 Q6ZS92 163 aa11.86□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 TMEM14CQ9P0S9 112 aa11.86□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 SIGLEC9Q9Y336 463 aa11.86□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa11.86□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 HSBP1L1C9JCN9 74 aa11.86□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 IGLC1P0CG04 106 aa11.86□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 BSPH1Q075Z2 132 aa11.86□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 TEX22C9J3V5 150 aa11.85□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 H0Y8G0 127 aa11.85□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 CSN3P07498 182 aa11.85□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 DLX1P56177 255 aa11.85□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 TMEM133Q9H2Q1 129 aa11.85□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa11.85□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 MUC21A0A140T8X8 626 aa11.85□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 HTR1DP28221 377 aa11.85□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 MUC21Q5SSG8 566 aa11.85□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 FAM57AQ8TBR7 257 aa11.85□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa11.85□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 HSPB8Q9UJY1 196 aa11.85□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 K7EM74 188 aa11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 ARMS2P0C7Q2 107 aa11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 RHOGP84095 191 aa11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 DEFB125Q8N687 156 aa11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GUT8 65 aa11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 C16orf97H3BN30 126 aa11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 THBDP07204 575 aa11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 NHLH1Q02575 133 aa11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 LINC01545Q5VT33 79 aa11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 ASCL2Q99929 193 aa11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 PMCHL2Q9BQD1 86 aa11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 MS4A6AQ9H2W1 248 aa11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 KAAG1Q9UBP8 84 aa11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 PIEZO1Q92508 2521 aa11.84□□□□□ -0.51
SYP-201ENST00000263233 CDKN1BP46527 198 aa11.83□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 C12orf54Q6X4T0 127 aa11.83□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 COL12A1Q99715 3063 aa11.83□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 OR2T8A6NH00 312 aa11.83□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 I3L2K1 104 aa11.83□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 HLA-DRB1P01911 266 aa11.83□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 PPP1R27Q86WC6 154 aa11.83□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 C17orf77Q96MU5 243 aa11.83□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 A0A0G2JNJ9 132 aa11.82□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 RBPJQ06330 500 aa11.82□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 GATD1Q8NB37 220 aa11.82□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 Q9UFV3 132 aa11.82□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 A0A087X0K7 114 aa11.82□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa11.82□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 RBP4P02753 201 aa11.82□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 TMEM75Q8N9X5 138 aa11.82□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 RASL11BQ9BPW5 248 aa11.82□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 FBXL15Q9H469 300 aa11.82□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 AP5S1Q9NUS5 200 aa11.82□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 INSIG2Q9Y5U4 225 aa11.82□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 TRBV19A0A075B6N1 114 aa11.81□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 IGKV1-17P01599 117 aa11.81□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 IGLV1-47P01700 117 aa11.81□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 RIGQ13278 110 aa11.81□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 ZNF747Q9BV97 191 aa11.81□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 NGBQ9NPG2 151 aa11.81□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 CBY3A6NI87 242 aa11.81□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 CRIP1P50238 77 aa11.81□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 FOXE3Q13461 319 aa11.81□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 NCR2O95944 276 aa11.8□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 ARF6P62330 175 aa11.8□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 TNFRSF14Q92956 283 aa11.8□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 PSG8Q9UQ74 426 aa11.8□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 ROS1P08922 2347 aa11.8□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa11.8□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.8□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 SCNM1Q9BWG6 230 aa11.8□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa11.8□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa11.79□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 CD5LO43866 347 aa11.79□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 COX8AP10176 69 aa11.79□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 IGF2-ASQ6U949 168 aa11.79□□□□□ -0.52
SYP-201ENST00000263233 C2orf91Q6ZV80 131 aa11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms