RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	GSTO1	P78417	241 aa		20.32	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAP3K11	Q16584	847 aa		20.32	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		20.32	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		20.32	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		20.32	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAI14	Q9P0K7	980 aa		20.32	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	UNCX	A6NJT0	531 aa		20.31	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	MCAM	P43121	646 aa		20.31	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		20.31	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	AACS	Q86V21	672 aa		20.31	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	20.31	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	BCL11A	Q9H165	835 aa		20.31	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	20.3	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	20.3	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	20.3	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	PI16	Q6UXB8	463 aa		20.3	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		20.3	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	20.3	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		20.3	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		20.3	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	TEPSIN	Q96N21	525 aa		20.3	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	SNRK	Q9NRH2	765 aa		20.3	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		20.3	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAB11FIP3	O75154	756 aa		20.29	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	MECOM	Q03112	1051 aa		20.29	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCP10	Q12799	353 aa		20.29	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	20.29	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	20.29	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	CSRNP1	Q96S65	589 aa		20.29	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	20.29	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		20.29	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	20.29	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	DCAF15	Q66K64	600 aa		20.28	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		20.28	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNS4	Q8IZW8	715 aa		20.28	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM151A	Q8WW52	585 aa		20.28	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	TSKS	Q9UJT2	592 aa		20.28	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	GAK	O14976	1311 aa		20.27	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	20.27	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	BTD	P43251	543 aa		20.27	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	SREBF2	Q12772	1141 aa		20.27	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	20.27	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	CSAD	Q9Y600	493 aa		20.27	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		20.27	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		20.26	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRPA1	O75762	1119 aa		20.26	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	20.26	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAP3K9	P80192	1104 aa		20.26	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPRYD7	Q5W111	196 aa		20.26	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		20.26	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	20.26	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		20.26	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	NFIA	Q12857	509 aa		20.25	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	20.25	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	20.25	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF186	Q9NXI6	227 aa		20.25	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		20.25	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		20.24	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGSF3	O75054	1194 aa		20.24	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	ENTPD3	O75355	529 aa		20.24	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	20.24	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	20.24	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZAP70	P43403	619 aa		20.24	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	INHBE	P58166	350 aa		20.24	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		20.24	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	WNK4	Q96J92	1243 aa		20.24	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		20.24	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	ELP3	Q9H9T3	547 aa		20.24	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	20.23	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	BAG3	O95817	575 aa		20.23	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	20.23	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	TM4SF4	P48230	202 aa		20.23	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	RGS3	P49796	1198 aa		20.23	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	IDI2	Q9BXS1	227 aa		20.23	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		20.23	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		20.23	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	20.22	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	PICALM	Q13492	652 aa		20.22	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	20.22	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	WRNIP1	Q96S55	665 aa		20.22	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	20.21	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLCG2	P16885	1265 aa		20.21	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	20.21	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	OPTN	Q96CV9	577 aa		20.21	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		20.21	■□□□□ 0.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAP3K12	Q12852	859 aa		20.2	■□□□□ 0.82
JMJD1C-211	ENST00000633035	VGLL4	Q14135	290 aa		20.2	■□□□□ 0.82
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFFO2	Q5TF58	517 aa		20.2	■□□□□ 0.82
JMJD1C-211	ENST00000633035	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		20.2	■□□□□ 0.82
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF384	Q8TF68	577 aa		20.2	■□□□□ 0.82
JMJD1C-211	ENST00000633035	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	20.2	■□□□□ 0.82
JMJD1C-211	ENST00000633035	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	20.19	■□□□□ 0.82
JMJD1C-211	ENST00000633035	ALDH1A1	P00352	501 aa		20.19	■□□□□ 0.82
JMJD1C-211	ENST00000633035	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	20.19	■□□□□ 0.82
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		20.19	■□□□□ 0.82
JMJD1C-211	ENST00000633035	TEX11	Q8IYF3	940 aa		20.19	■□□□□ 0.82
JMJD1C-211	ENST00000633035	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	20.19	■□□□□ 0.82
JMJD1C-211	ENST00000633035	AK9	Q5TCS8	1911 aa		20.18	■□□□□ 0.82
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYP7A1	P22680	504 aa		20.18	■□□□□ 0.82
JMJD1C-211	ENST00000633035	RHBDL3	P58872	404 aa		20.18	■□□□□ 0.82

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