RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 GTF3C6Q969F1 213 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 CHMP6Q96FZ7 201 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 RILPQ96NA2 401 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 AKNAQ7Z591 1439 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 PTPRCP08575 1304 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 CALUO43852 315 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 HACE1Q8IYU2 909 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 BRF1Q92994 677 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 ABCC11Q96J66 1382 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 CCDC169A6NNP5 214 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 NDUFAB1O14561 156 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 PPFIA3O75145 1194 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 RASSF2P50749 326 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 ASIC2Q16515 512 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 DTHD1Q6ZMT9 781 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 CCDC186Q7Z3E2 898 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 ASIC3Q9UHC3 531 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 INPP5BP32019 993 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 SV2BQ7L1I2 683 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 NOP56O00567 594 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 RNF8O76064 485 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 PDE6AP16499 860 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 KRT15P19012 456 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 GNAT2P19087 354 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 ARHGAP25P42331 645 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 DCUN1D2Q6PH85 259 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 RUFY4Q6ZNE9 571 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM71BQ8TC56 605 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 SETDB2Q96T68 719 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 TRIM35Q9UPQ4 493 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 S100BP04271 92 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 TRIM14Q14142 442 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 MUM1Q2TAK8 710 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 TMTC4Q5T4D3 741 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 IFT20Q8IY31 132 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 MAIP1Q8WWC4 291 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 P3H4Q92791 437 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 RBSNQ9H1K0 784 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 STK24Q9Y6E0 443 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 ERBINQ96RT1 1412 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 PPFIA1Q13136 1202 aa4.5□□□□□ -1.69
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ANKRD28-215ENST00000624145 EP400NLQ6ZTU2 488 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 DNAJC25Q9H1X3 360 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC52A1Q9NWF4 448 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 PIK3R4Q99570 1358 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 HFM1A2PYH4 1435 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 TRAF5O00463 557 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 SPTLC2O15270 562 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 GSTA1P08263 222 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 GSTA2P09210 222 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 P4HA1P13674 534 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 MX2P20592 715 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 MTMR3Q13615 1198 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 KLHL40Q2TBA0 621 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 USHBP1Q8N6Y0 703 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 PICK1Q9NRD5 415 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 PKD2L1Q9P0L9 805 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 ITM2BQ9Y287 266 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 NAIPQ13075 1403 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 ARHGAP42A6NI28 874 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 F6X3S4 739 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 OPHN1O60890 802 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 TTC4O95801 387 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 STX17P56962 302 aa4.49□□□□□ -1.69
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ANKRD28-215ENST00000624145 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 LCA5Q86VQ0 697 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 POMGNT1Q8WZA1 660 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 EYA3Q99504 573 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 NYXQ9GZU5 481 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 USTQ9Y2C2 406 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 DAPK1P53355 1430 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28-215ENST00000624145 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
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