RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	FAM83A	Q86UY5	434 aa		24.58	■■□□□ 1.53
PSME3-209	ENST00000589469	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		24.58	■■□□□ 1.53
PSME3-209	ENST00000589469	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	24.58	■■□□□ 1.53
PSME3-209	ENST00000589469	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		24.58	■■□□□ 1.53
PSME3-209	ENST00000589469	GAK	O14976	1311 aa		24.58	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	MECOM	Q03112	1051 aa		24.57	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		24.57	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	TEPSIN	Q96N21	525 aa		24.57	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		24.57	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	SNRK	Q9NRH2	765 aa		24.57	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	RAI14	Q9P0K7	980 aa		24.57	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	MAP3K11	Q16584	847 aa		24.56	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	24.56	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	USP40	Q9NVE5	1235 aa		24.56	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		24.56	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	FZD1	Q9UP38	647 aa		24.56	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	FOXN1	O15353	648 aa		24.55	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	GSTO1	P78417	241 aa		24.55	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		24.55	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		24.55	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		24.55	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	24.54	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	24.54	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	ZIC5	Q96T25	663 aa		24.54	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	LDHC	P07864	332 aa		24.53	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	24.53	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	BTD	P43251	543 aa		24.53	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	ZAP70	P43403	619 aa		24.53	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	24.53	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	24.53	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	UNCX	A6NJT0	531 aa		24.52	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	24.52	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	24.52	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF384	Q8TF68	577 aa		24.52	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	FAM151A	Q8WW52	585 aa		24.52	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	HOOK2	Q96ED9	719 aa		24.52	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	CRBN	Q96SW2	442 aa		24.52	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	BCL11A	Q9H165	835 aa		24.52	■■□□□ 1.52
PSME3-209	ENST00000589469	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	24.51	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	NFIA	Q12857	509 aa		24.51	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	PCNT	O95613	3336 aa		24.5	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		24.5	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	CA12	O43570	354 aa		24.5	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	IGSF3	O75054	1194 aa		24.5	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	TCP10	Q12799	353 aa		24.5	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		24.5	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		24.5	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		24.5	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	24.49	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	24.49	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		24.49	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	IDI2	Q9BXS1	227 aa		24.49	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		24.48	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	24.48	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	24.48	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	24.48	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		24.48	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		24.47	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	ENTPD3	O75355	529 aa		24.47	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	24.47	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	24.47	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	RGS3	P49796	1198 aa		24.47	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	DCAF15	Q66K64	600 aa		24.47	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	DCTPP1	Q9H773	170 aa		24.47	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		24.46	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	24.46	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	SPRYD7	Q5W111	196 aa		24.46	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	CSRNP1	Q96S65	589 aa		24.46	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		24.46	■■□□□ 1.51
PSME3-209	ENST00000589469	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	24.45	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	24.45	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	LBX1	P52954	281 aa		24.45	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	RHBDL3	P58872	404 aa		24.45	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	PICALM	Q13492	652 aa		24.45	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	24.45	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	24.45	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		24.45	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		24.45	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	24.44	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	MAP3K9	P80192	1104 aa		24.44	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		24.44	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	WNK4	Q96J92	1243 aa		24.44	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	CSAD	Q9Y600	493 aa		24.44	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		24.44	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	BAG3	O95817	575 aa		24.43	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	24.43	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	24.43	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	24.43	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	WRNIP1	Q96S55	665 aa		24.43	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		24.43	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		24.43	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	ELP3	Q9H9T3	547 aa		24.43	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	24.43	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		24.43	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	TSKS	Q9UJT2	592 aa		24.43	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	PLCG2	P16885	1265 aa		24.42	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	SREBF2	Q12772	1141 aa		24.42	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	MAP3K12	Q12852	859 aa		24.42	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	VGLL4	Q14135	290 aa		24.42	■■□□□ 1.5
PSME3-209	ENST00000589469	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		24.42	■■□□□ 1.5

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